[发明专利]一种检测酿酒酵母染色体大片段重复的位置的方法有效
申请号: | 201610098415.6 | 申请日: | 2016-02-23 |
公开(公告)号: | CN105624306B | 公开(公告)日: | 2020-06-12 |
发明(设计)人: | 元英进;谢泽雄;李炳志 | 申请(专利权)人: | 天津大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 赵青朵 |
地址: | 300072 天津市*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 酿酒 酵母 染色体 片段 重复 位置 方法 | ||
1.一种快速检测酿酒酵母染色体大片段重复的位置的方法,其特征在于,包括:
步骤A、对待测酿酒酵母菌株进行基因组测序,利用基因组测序揭示待测酿酒酵母菌株中存在重复大片段基因组DNA的染色体;
步骤B、在待测酿酒酵母菌株相反交配型的野生型酵母菌株对应染色体着丝粒处添加半乳糖启动子;
步骤C、利用核内复制回交(endoreduplication backcross)获得全新的单倍体酵母菌株;
步骤D、对步骤C获得全新的单倍体酵母菌株进行基因组测序,与待测酿酒酵母菌株的基因组测序结果比较,确定大片段重复的位置;
步骤C具体包括以下步骤:
1)将待测酿酒酵母菌株与所述添加半乳糖启动子的野生型酵母菌株进行融合,获得二倍体酵母菌株;
2)半乳糖诱导二倍体菌株中GAL1启动子表达,获得只携带源染色体的二倍体酿酒酵母菌株;
3)对步骤2)获得酿酒酵母菌株进行生孢实验并进行孢子拆分。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,分析比较结果,若全新的单倍体酵母菌株的基因组测序结果中存在大片段重复DNA,则大片段重复存在于待测酿酒酵母菌株染色体上。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,分析比较结果,若全新的单倍体酵母菌株的基因组测序结果中不存在大片段重复DNA,则大片段重复存在于待测酿酒酵母菌株染色体以外的染色体上。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤1)所述融合的具体为挑取待测单倍体酿酒酵母菌株和添加半乳糖启动子的具有相反交配型的单倍体酿酒酵母菌株单菌落于无菌水中进行混合,然后滴于YPD培养平板上过夜培养,营养缺陷型培养平板筛选二倍体菌株,挑取单菌落验证。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤3)所述孢子拆分的具体为利用酵母显微操作仪进行酿酒酵母孢子的拆分。
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