[发明专利]miRancer分子的设计与应用在审

专利信息
申请号: 201610084172.0 申请日: 2016-02-04
公开(公告)号: CN107034216A 公开(公告)日: 2017-08-11
发明(设计)人: 朱涛;李高朋;彼得·E·洛比 申请(专利权)人: 中国科学技术大学
主分类号: C12N15/113 分类号: C12N15/113;C12N15/10;C12Q1/68
代理公司: 中科专利商标代理有限责任公司11021 代理人: 张国梁
地址: 230026 安*** 国省代码: 安徽;34
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摘要:
搜索关键词: mirancer 分子 设计 应用
【权利要求书】:

1.一种结合目标microRNA的单链RNA序列,所述单链RNA序列具有5'端臂和3'端臂,所述5'端臂通过碱基互补配对与目标microRNA结合,所述3'端臂通过碱基互补配对与所述5'端臂结合,

所述单链RNA序列从5'端到3'端具有以下通式1:

(n5-11)(n0-3)(n6-7)(n1)(n11-21)(n0-2),

其中n为连续的核苷酸或其类似物,其后数字为核苷酸或其类似物的个数,其中n1与目标microRNA的5'端第一位的核苷酸互补,相应的n6-7对应于目标microRNA从5'端到3'端的第2-7位或第2-8位,从而(n5-11)(n0-3)(n6-7)为5'端臂,(n11-21)(n0-2)为3'端臂,其中n0-3为插入的C或G以在所述5'端臂和3'端臂之间形成GC配对。

2.权利要求1所述的单链RNA序列,其中除了插入的(n0-3)作为缺口不计算同一性之外,所述5'端臂与所述目标microRNA从5'端到3'端的第2-18位核苷酸的互补链至少50%、60%、70%、80%、90%、或100%的同一性,优选其中(n6-7)与所述目标microRNA从5'端到3'端的第2-7位或第2-8位核苷酸的互补链具有至少80%、90%、或100%的同一性,优选(n11-21)与(n5-11)(n0-3)(n6-7)中不配对核苷酸的个数小于6、5、4、3、2、或1对,优选全部不配对的核苷酸在(n1)周围。

3.一种包含权利要求1或2所述单链RNA序列的载体,如质粒。

4.一种包含编码权利要求1或2所述单链RNA序列的多核苷酸序列的载体,如质粒。

5.一种包含权利要求1或2所述单链RNA序列的合成的RNA分子。

6.一种包含权利要求3或4的载体的细胞。

7.权利要求1或2的单链RNA序列、权利要求3或4的载体、或权利要求5的合成的RNA分子的用途,所述用途包括用于特异性增加内源性和/或外源性目标microRNA或其它小RNA的表达和/或活性,用于体外和/或体内特异性调节所述目标microRNA靶向的基因的表达,用作感受器用于感测所述目标microRNA或其它小RNA,和用于通过感测所述目标microRNA或其它小RNA从而调节所述所述目标microRNA或其它小 RNA靶向的基因的表达。

8.一种方法,所述方法包括用于特异性增加内源性和/或外源性目标microRNA或其它小RNA的表达和/或活性的方法,用于体外和/或体内特异性调节所述目标microRNA靶向的基因的表达的方法,用作感受器用于感测所述目标microRNA或其它小RNA的方法,和用于通过感测所述目标microRNA或其它小RNA从而调节所述所述目标microRNA或其它小RNA靶向的基因的表达方法,所述方法包括将权利要求1或2的单链RNA序列、权利要求3或4的载体、或权利要求5的合成的RNA分子与包含目标microRNA或其它小RNA的样品接触的步骤。

9.一种产生结合目标microRNA的单链RNA序列的方法,所述方法包括产生权利要求1或2所述的结合目标microRNA的单链RNA序列。

10.一种组合物或试剂盒,其包含权利要求1或2的单链RNA序列、权利要求3或4的载体、和/或权利要求5的合成的RNA分子,优选的所述组合物或试剂盒用于权利要求7所述的用途或权利要求8所述的方法。

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