[发明专利]用于普通野生稻遗传完整性分析的引物组合及其应用

说明书

本发明涉及遗传完整性分析引物，具体公开了用于普通野生稻遗传完整性分析的SSR分子标记核心引物及其应用。本发明以江西普通野生稻为材料，通过大量实验研究，筛选出了一批可用于普通野生稻遗传完整性分析的SSR核心引物，建立了用于普通野生稻遗传完整性分析的引物组合，并基于此，建立了分析方法。本发明提供的分析方法适用于普通野生稻种质遗传完整性的分析。所筛选的引物组合和最少90个单株的群体量，为准确分析普通野生稻种质保存和繁殖更新过程中遗传完整性检测提供了标准方法。

技术领域

本发明涉及遗传完整性分析引物，具体地说，涉及用于普通野生稻遗传完整性分析的SSR分子标记核心引物。

背景技术

普通野生稻是栽培稻的近缘祖先种，蕴藏着大量优良基因资源，其亲和性好，杂交结实率高，是栽培稻育种的珍贵基因资源。普通野生稻是我国野生稻中分布最广的一个种，然而，近几十年来，由于环境破坏等原因，其分布面积极大退化。普通野生稻种质资源保护的主要方式包括：原生境保护、种质圃保护和种质库保存种子。其保护保存的目标十分明确：保持其遗传完整性和多样性。

种质遗传完整性是指种质原始遗传组成状态。种质资源保护和保存需要保证在保存和繁殖更新过程中群体的遗传结构得到完全的保持，包括基因型频率及等位基因频率等与原始群体保持一致。因此准确评价种质的遗传完整性具有重要的理论和实践意义。

因此，亟需获得可用于普通野生稻遗传完整性分析的SSR核心引物，并建立普通野生稻遗传完整性分析方法。

发明内容

为了解决现有技术中存在的问题，本发明的目的是提供一种用于普通野生稻遗传完整性分析的引物组合及其应用。

为了实现本发明目的，本发明的技术方案如下：

本发明提供一套用于普通野生稻遗传完整性分析的SSR核心引物组合与方法，所述方法是基于SSR分子标记原理，采用经过前期大量筛选工作所获得的25对多态性核心引物，对90～160个单株的普通野生稻基因组DNA进行扩增，利用生物分析软件统计分析群体的遗传多样性指数，反映群体的遗传完整性保持情况。

第一方面，本发明提供用于普通野生稻遗传完整性分析的引物组合，其由如下25个引物对组成：

SSR01：正向引物如SEQ ID NO.1所示；反向引物如SEQ ID NO.2所示；

SSR02：正向引物如SEQ ID NO.3所示；反向引物SEQ ID NO.4所示；

SSR03：正向引物如SEQ ID NO.5所示；反向引物如SEQ ID NO.6所示；

SSR04：正向引物如SEQ ID NO.7所示；反向引物如SEQ ID NO.8所示；

SSR05：正向引物如SEQ ID NO.9所示；反向引物如SEQ ID NO.10所示；

SSR06：正向引物如SEQ ID NO.11所示；反向引物如SEQ ID NO.12所示；

SSR07：正向引物如SEQ ID NO.13所示；反向引物如SEQ ID NO.14所示；

SSR08：正向引物如SEQ ID NO.15所示；反向引物如SEQ ID NO.16所示；

SSR09：正向引物如SEQ ID NO.17所示；反向引物如SEQ ID NO.18所示；

SSR10：正向引物如SEQ ID NO.19所示；反向引物如SEQ ID NO.20所示；

SSR11：正向引物如SEQ ID NO.21所示；反向引物如SEQ ID NO.22所示；