[发明专利]使用基因组编辑技术CRISPR-Cas9诱导CCR5Δ32缺失的方法在审
申请号: | 201610028603.1 | 申请日: | 2016-01-18 |
公开(公告)号: | CN105567738A | 公开(公告)日: | 2016-05-11 |
发明(设计)人: | 魏民;齐春侠 | 申请(专利权)人: | 南开大学 |
主分类号: | C12N15/867 | 分类号: | C12N15/867 |
代理公司: | 天津佳盟知识产权代理有限公司 12002 | 代理人: | 侯力 |
地址: | 300071*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 使用 基因组 编辑 技术 crispr cas9 诱导 ccr5 32 缺失 方法 | ||
1.使用基因组编辑技术CRISPR-Cas9诱导CCR5Δ32缺失的方法,其特征在于使用了基 因组编辑技术——成簇的、规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白CRISPR-Cas9技术,成 功诱导了CCR5Δ32缺失,该方法的具体内容包括:
第一、引导RNA(gRNA)的设计
为达到获得CCR5Δ32/Δ32纯合子细胞的目的,针对于CCR5Δ32两侧的目标序列设计 一对gRNA,左侧的目标序列为gRNA对应的DNA序列SEQIDNo.1或者SEQIDNo.3-19中的任 一个序列,右侧的目标序列为gRNA对应的DNA序列SEQIDNo.2或者SEQIDNo.20-36中的 任一个序列;
第二、根据第一步设计的gRNA,将对应的DNA插入到CRISPR-Cas9载体质粒中,构建功能 质粒,该质粒具有以下特点:
①该质粒带有核酸酶Cas9表达读码框、CRISPR其他相关基因序列和慢病毒包装信号;
②针对CCR5Δ32位点两侧的gRNA,如第一步所述;
第三、包裹CRISPR-Cas9质粒的慢病毒颗粒的制备:
将第二步构建的CRISPR-Cas9质粒和包装质粒PMD2.G、psPAX2共同转染到HEK293T细胞 中,一段时间后收取细胞上清液,该上清中含有我们所需要的慢病毒颗粒;
第四、将第三步获得的慢病毒颗粒感染目的细胞,就能够获得CCR5Δ32/Δ32纯合子细 胞。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于所述的目标序列还可以是SEQIDNo1.和 SEQIDNo.20-36的任意组合;SEQIDNo2.和SEQIDNo.20-36的任意组合;……SEQID No19.和SEQIDNo.20-36的任意组合;由于CRISPR-Cas9的容错性,个别碱基发生改变,也 可以被识别,因此只要带有种子DNA序列“5’taatgtc3’”和“5’gactgta3’”的gRNA针对于 CCR5Δ32缺失就在本发明保护范围内。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于所述切割使用的核酸酶还可以是Cas9的突 变体——Cas9切口酶,或者其他的Cas9突变体,或者核酸酶FokI。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于所述的质粒载体可以不是慢病毒载体,而是 腺病毒载体;或者其他的带有CRISPR-Cas9的任意质粒载体。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于所述的方法可以不是慢病毒感染,可以是质 粒直接转染。
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