[发明专利]头颈部癌症的生物标志物及其使用方法有效
申请号: | 201580056428.0 | 申请日: | 2015-10-16 |
公开(公告)号: | CN107148476B | 公开(公告)日: | 2021-06-08 |
发明(设计)人: | 世龙·路;约翰·宋 | 申请(专利权)人: | 科罗拉多大学董事会法人团体 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 宋融冰 |
地址: | 美国科*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 颈部 癌症 生物 标志 及其 使用方法 | ||
1.一组诊断性编码微RNA的甲基化基因组基因座在制备用于检测受试者体内头颈癌症的试剂盒中的用途,包括:
(a)测定分离自所述受试者的组织或体液中的编码至少一种微RNA的至少一个基因组基因座(mgmiR)的甲基化水平,所述至少一个mgmiR选自由124-1、124-2和124-3所组成的组,和
(b)将所述编码至少一种微RNA的至少一个基因组基因座(mgmiR)的所述甲基化水平与基础甲基化水平进行比较,所述基础甲基化水平是来自已知无所述头颈癌症的个体的相同组织或体液的相同mgmiR的所述甲基化水平,
其中所述受试者体内所述至少一个mgmiR与所述基础甲基化水平相比显著更高的甲基化水平指示所述受试者体内的头颈癌症或癌前病变。
2.根据权利要求1所述的用途,其中所述头颈癌症是头颈部鳞状细胞癌HNSCC。
3.根据权利要求1所述的用途,进一步包括步骤(c):用选自由手术、化学疗法、放射疗法以及它们的组合所组成的组的治疗方法治疗所述受试者。
4.根据权利要求1所述的用途,其中所述至少一个基因组基因座与所述基础甲基化水平相比高出至少100%的甲基化水平指示头颈癌症。
5.根据权利要求1所述的用途,其中所述编码所述至少一种微RNA的至少一个基因组基因座分离自组织或体液,所述组织或体液选自由头部组织、颈部组织、口腔拭子、鼻腔拭子、唾液和它们的组合所组成的组。
6.根据权利要求1所述的用途,其中需要所述受试者体内至少两个mgmiR与所述基础水平相比显著更高的甲基化水平来指示头颈癌症或癌前病变的存在,所述至少两个mgmiR选自由124-1、124-2和124-3所组成的组。
7.根据权利要求1所述的用途,其中需要所述受试者体内至少三个mgmiR与所述基础水平相比显著更高的甲基化水平来指示头颈癌症或癌前病变的存在,所述至少三个mgmiR选自由124-1、124-2和124-3所组成的组。
8.根据权利要求1所述的用途,其中
所述步骤(a)包括测定分离自所述受试者的组织或体液中的至少一种微RNA的水平,所述至少一种微RNA选自由124-1、124-2和124-3所组成的组,和
所述步骤(b)包括将所述至少一种微RNA的所述水平与基础微RNA水平进行比较,所述基础微RNA水平是来自已知无所述头颈癌症的个体的相同组织或体液的相同微RNA的水平,
其中所述受试者体内所述至少一种微RNA与所述基础微RNA水平相比显著较低的水平指示头颈癌症或癌前病变。
9.根据权利要求1所述的用途,其中所述步骤(a)包括:
(a1)从所述受试者的所述组织或体液制备DNA提取物,所述DNA提取物包含第一DNA片段,所述第一DNA片段含有编码至少一种选自由124-1、124-2和124-3所组成的组的微RNA的至少一个基因组基因座,
(a2)使用所述第一DNA片段作为模板且使用选自由(1)SEQ ID No.1和2、(2)SEQ IDNo.3和4、和(3)SEQ ID No.5和6所组成的组的寡核苷酸引物对,通过定量聚合酶链反应(qPCR)产生第二DNA片段,
(a3)测定步骤(a2)中产生的所述第二DNA片段的水平,和
所述步骤(b)包括将所述第二DNA片段的所述水平与基础水平进行比较,所述基础水平是从已知无所述头颈癌症的个体的相同组织或体液中以相同的方式产生的相应DNA片段的水平,
其中所述第二DNA片段与所述基础水平相比较高的水平指示头颈癌症或癌前病变。
10.根据权利要求9所述的用途,其中所述第二DNA片段与所述基础水平相比高出100%的水平指示头颈癌症的存在。
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