[发明专利]不动杆菌属溶素

说明书

针对革兰氏阴性细菌具有杀灭活性的不动杆菌属溶素多肽和变体肽。用于使用不动杆菌属溶素多肽治疗细菌性感染或细菌定殖的方法。

相关申请的交叉引用

本PCT申请要求2014年6月26日提交的美国临时申请序列号62/017,618的优先权，所述美国临时申请的公开内容据此以引用的方式整体并入本文。

序列表

本申请以引用的方式整体并有2015年6月24日创建，并且与此一起电子提交，题为“235932-373399_Sequence_Listing_ST25”的序列表(57KB)。

领域

包含对不动杆菌属(Acinetobacter)具有特异性的噬菌体溶解酶的组合物和用于治疗不动杆菌属感染的方法。

背景

鲍氏不动杆菌-乙酸钙复合体(Acinetobacter baumannii-calcoaceti cuscomplex)和这个种类的其它成员常常在无伤害下定殖于人皮肤。然而，由刮擦、创伤或手术对皮肤所致的损伤可导致不动杆菌属感染创伤、血液、软组织和中枢神经系统。鉴于80％的不动杆菌属种也具有多重抗药性(MDR)(至少三类抗生素)，这些感染可导致不利临床结果，包括高致病率和致死率、医院停留延长和大量健康护理费用。军事人员和运动员具有增加的将易受不动杆菌属种感染的损伤(从皮肤磨损直至重度创伤)的风险，因此用以将它们快速和有效移除的方法将减少或消除下游并发症。由MDR不动杆菌属引起的暴发已在全世界的医院中被报道；更新近地，它们已成为军事医学机构中的严重问题。由于它的MDR，所以不动杆菌属感染难以治疗，因此由这些生物体达成的感染通常导致不良结果。因此，需要控制这个病原体的新的和更好方式。

现已报道对所有已知抗生素都具有抗性的鲍氏不动杆菌菌株。与这个出现的抗性概况协同起作用的是鲍氏不动杆菌具有在整个医院环境中持续延长时期存活的离奇能力，由此增强它达成医院扩散的能力。所述生物体通常以在皮肤完整性和气道保护方面具有缺口的病危住院受试者为目标。因此，医院获得性肺炎仍然是由鲍氏不动杆菌引起的最常见感染。然而，近来，涉及中枢神经系统、皮肤和软组织以及骨的感染已作为某些机构的高度问题性感染而出现。由于这个抗性问题，所以必须开发用以控制这些病原体的新方法。

已鉴定称为噬菌体编码溶素(lysin)的抗微生物剂。噬菌体是感染细菌的病毒，并且据估计存在10⁶个不同噬菌体种类。噬菌体溶素通常具有属特异性或种特异性，即金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)噬菌体溶素可仅针对金黄色葡萄球菌具有活性，从而提供靶向治疗方法。在一些情况下，溶素可具有针对若干属或种的活性。

噬菌体感染它们的宿主细菌以产生更多病毒粒子。在繁殖周期结束时，它们面临一个问题，即如何释放圈闭在细菌内的子代噬菌体。它们通过产生称为“溶素”的酶来解决这个问题，所述酶降解受感染细菌的细胞壁以释放子代噬菌体。溶解系统由穿孔素(holin)和至少一种能够降解细菌细胞壁的肽聚糖水解酶或溶素组成。通常，穿孔素在噬菌体感染的晚期表达，从而在细胞膜中形成孔，允许溶素到达细胞壁肽聚糖，导致子代噬菌体释放。值得注意的是，外源添加的溶素在不存在穿孔素下可溶解健康未感染细胞的细胞壁，从而产生称为“自外溶解(lysis from without)”的现象。

概述

我们近来已鉴定、纯化和表征特异性攻击不动杆菌属细菌的若干噬菌体溶素。这是一个突破，因为大多数溶素仅针对革兰氏阳性细菌具有抗细菌活性。本发明的纯化噬菌体溶素充分适合于多种应用，诸如治疗细菌性感染和消毒。

附图简述

图1A.显示从鲍氏不动杆菌菌株1790诱导的噬菌体的负染色电子显微照片。

图1B.显示从鲍氏不动杆菌菌株1794诱导的噬菌体的负染色电子显微照片