[发明专利]用于单核细胞增多性李斯特菌检测的序列和它们的用法在审
申请号: | 201580039030.6 | 申请日: | 2015-07-16 |
公开(公告)号: | CN106661626A | 公开(公告)日: | 2017-05-10 |
发明(设计)人: | S.L.布鲁梅曼;S.瓦基;M.A.詹森;D.R.德马科 | 申请(专利权)人: | 纳幕尔杜邦公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司72001 | 代理人: | 唐华东,黄希贵 |
地址: | 美国特*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 单核 细胞 增多 李斯特 检测 序列 它们 用法 | ||
1.一种用于检测样品中单核细胞增多性李斯特菌的存在的方法,所述样品包含核酸,所述方法包括:
(a)提供反应混合物,所述反应混合物包含合适的引物对,所述合适的引物对用于扩增推定的肌醇单酮异构酶蛋白(IoII)基因的至少一部分;
(b)使用所述步骤(a)的反应混合物进行所述样品的所述核酸的PCR扩增;以及
(c)检测所述步骤(b)的扩增,从而扩增的阳性检出表明所述样品中所述单核细胞增多性李斯特菌的存在。
2.根据权利要求1所述的方法,其中步骤(a)包括用于扩增SEQ ID NO:1的合适的引物对。
3.根据权利要求2所述的方法,其中用于扩增所述SEQ ID NO:1的核酸区域的所述引物对选自:
(A)SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:8、以及SEQ ID NO:9和SEQ IDNO:10。
4.根据权利要求3所述的方法,其中所述反应混合物还包含用于各个待检测核酸区域的至少一种核酸探针。
5.根据权利要求4所述的方法,其中所述至少一种核酸探针选自SEQ ID NO:11、12、13、14、15和16。
6.根据权利要求5所述的方法,其中所述至少一种核酸探针中的每一者包含可检测的标记。
7.根据权利要求1所述的方法,其中所述样品包括食物样品或环境样品。
8.一种引物,其包含基于BLASTN比对方法与SEQ ID NO:2、3、4、5、6、7、8、9或10中所示的多核苷酸序列具有至少95%序列同一性的多核苷酸序列。
9.根据权利要求8所述的引物,其中所述引物包含SEQ ID NO:2、3、4、5、6、7、8、9或10中所示的多核苷酸序列。
10.一种单核细胞增多性李斯特菌血清型检测序列,其包括基于所述BLASTN比对方法与SEQ ID NO:1中所示的多核苷酸序列具有至少95%序列同一性的多核苷酸序列。
11.根据权利要求10所述的单核细胞增多性李斯特菌血清型检测序列,其包括SEQ ID NO:1中所示的多核苷酸序列。
12.一种分离的多核苷酸,其包含基于所述BLASTN比对方法与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16中所示的多核苷酸序列具有至少95%序列同一性的多核苷酸序列。
13.根据权利要求12所述的分离的多核苷酸,其中所述分离的多核苷酸包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ IDNO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16中所示的多核苷酸序列。
14.一种用于进行PCR的复制组合物,其包含:
(a)选自下列的一组引物对:
(i)SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:7;
(ii)SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:5;
(iii)SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5;
(iv)SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6;
(v)SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:8;以及
(vi)SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10。
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