[发明专利]基于改进PCR计算模型求解最大团问题的方法

权利要求书

1.基于改进PCR计算模型求解最大团问题的方法，其特征在于，如下步骤：

步骤1：建立无向图的补图；

步骤2：用DNA链表示补图的顶点子集，并对DNA链进行编码,利用PCR技术对DNA链上的 特定片段进行复制并利用XPCR技术生成解空间；

步骤3：给定一条补图边,每条补图边对应两个顶点，筛选出含有这两个顶点的一个或 两个的DNA链，放入试管；

步骤4：对试管中的DNA链重复步骤3，直到所有的补图边均被筛选过；

步骤5：从步骤4所得结果中，利用PCR技术筛选出试管中最短的DNA链作为含有最少顶 点数的子集；

步骤6：对步骤5中所得子集求补，得到最终结果。

2.根据权利要求1所述的基于改进了的PCR计算模型求解最大团问题的方法,其特征在 于:对于给定的无向图G＝(V,E),其中V＝{v₁,...,v_n},E＝{e₁,...,e_m},求解具体步骤如 下：

1)建立无向图G的补图

2)用DNA序列对补图中的每个顶点进行DNA序列编码，采用二进制编码顶点子集,编 码格式为其中U_iX代表第i个顶点在顶点子集中的状态；并 生成无向图G的所有可能顶点子集，即为解空间；

3)对补图中的所有的边进行编号，每条边均由两个顶点唯一确定

4)给定一条补图中的边利用PCR技术筛选含有v_i或v_l的DNA链，并放入特 定试管T中；

5)对试管T中DNA链重复步骤4，直到所有的补图边均被筛选过；

6)利用PCR技术筛选出试管T中，含有最少的顶点的子集，并对这些子集求补，即为最终 结果。

3.根据权利要求1或2所述的基于改进了的PCR计算模型求解最大团问题的方法,其特 征在于:所述DNA链为DNA双链。

4.根据权利要求1所述的基于改进PCR计算模型求解最大团问题的方法，其特征在于， 所述步骤2中生成解空间的具体方法如下：利用PCR技术，对初始DNA双链分子按照顶点编 号，逐位循环进行XPCR交叉连接，XPCR进行的过程中会伴随DNA双链分子的指数扩增，对于n 个顶点的简单无向图，循环n次得到图所有的顶点子集，则试管中生成的DNA双链分子表示 所有的顶点子集，得到解空间。

5.根据权利要求1所述的基于改进PCR计算模型求解最大团问题的方法，其特征在于： 所述步骤3中筛选的方法为通过XPCR操作对含有特定DNA分子序列的DNA分子后面添加指定 序列β,以DNA分子片段ω和β的后缀分别作为PCR操作的前端与后端引物，对添加了特定序 列β的DNA分子进行指数扩增，扩增后以DNA分子的长度作为DNA序列分离的特征条件，通过 凝胶电泳对DNA序列进行分离，筛选出含有特定顶点的顶点子集。