[发明专利]荧光定量PCR法检测TOP2A基因表达的引物、探针及试剂盒在审

专利信息
申请号: 201510824467.2 申请日: 2015-11-24
公开(公告)号: CN105400873A 公开(公告)日: 2016-03-16
发明(设计)人: 王秀娟;梁惠;段卫涛;赵平锋 申请(专利权)人: 武汉海吉力生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 北京汇泽知识产权代理有限公司 11228 代理人: 张瑾;程殿军
地址: 430000 湖北省武汉市东湖技术*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 荧光 定量 pcr 检测 top2a 基因 表达 引物 探针 试剂盒
【权利要求书】:

1.荧光定量检测TOP2A基因mRNA的引物对A和Taqman探针A,其特征在于,引物对A的核苷酸序列如SEQIDNO:1~2所示,Taqman探针A的核苷酸序列如SEQIDNO:3所示。

2.根据权利要求1所述的荧光定量检测TOP2A基因的引物对A和Taqman探针A,其特征在于,Taqman探针A的核苷酸序列5’端标记的荧光报告基团为FAM,3’端标记的淬灭基团为MGB。

3.一种荧光定量PCR法检测TOP2A基因表达的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1或2所述的荧光定量检测TOP2A基因的引物对A和Taqman探针A。

4.根据权利要求3所述的荧光定量PCR法检测TOP2A基因表达的试剂盒,其特征在于,还包括用于检测内参基因B2MmRNA的引物对B和Taqman探针B,引物对B的核苷酸序列如SEQIDNO:4~5所示,Taqman探针B的核苷酸序列如SEQIDNO:6所示。

5.根据权利要求4所述的荧光定量PCR法检测TOP2A基因表达的试剂盒,其特征在于,还包括TOP2A标准品、B2M标准品和阴性对照品,TOP2A标准品为含有梯度浓度TOP2A基因组质粒DNA的溶液,B2M标准品为含有梯度浓度B2M基因组质粒DNA的溶液。

6.根据权利要求5所述的荧光定量PCR法检测TOP2A基因表达的试剂盒,其特征在于,还包括第一链cDNA合成体系,具体包括反转录酶1~5U、反转录10×RTBuffe适量、dNTPs1~2mM、TOP2A基因反转录引物对1~10pM、内参基因B2M反转录引物对1~10pM,用DEPC水补足至19.5μL;使用时加入样本RNA0.5μg。

7.根据权利要求6所述的荧光定量PCR法检测TOP2A基因表达的试剂盒,其特征在于,试剂盒内共有五管试剂,分别为:

第一链cDNA合成体系;

荧光定量PCR检测反应液:含有TaqDNA聚合酶1~2U、2.0~5.0mmolMgCl2和0.2~0.8mmoldNTPs的Premix;引物对A1~10pM;Taqman探针A1~10pM;引物对B1~10pM;Taqman探针B1~10pM;DEPC水适量;

TOP2A标准品;

B2M标准品;

阴性对照品:DEPC水。

8.权利要求4~7任一所述的荧光定量PCR法检测TOP2A基因表达的试剂盒的使用方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)以肿瘤组织和癌旁正常组织为待检样品,提取待检样品中的RNA,反转录成样品cDNA;

(2)以样品cDNA作为模板,用引物对A、Taqman探针A、引物对B和Taqman探针B进行荧光定量PCR反应;TOP2A标准品和B2M标准品也分别进行与样品cDNA同样的操作,并根据TOP2A标准品和B2M标准品绘制标准曲线;

(3)结果分析:分析标准曲线的R2在0.99以上,TOP2A基因和B2M基因扩增效率应在94-100%范围,再根据荧光定量PCR仪器给出的Ct值,进行如下计算:

△Ct(肿瘤组织)=Ct(待检肿瘤组织样品)-Ct(B2M基因);

△Ct(癌旁正常组织)=Ct(待检癌旁正常组织样品)-Ct(B2M基因);

△△Ct=△Ct(肿瘤组织)-△Ct(癌旁正常组织);

相对表达率>1判断为乳腺癌TOP2A基因高表达。

9.根据权利要求8所述的荧光定量PCR法检测TOP2A基因表达的试剂盒的使用方法,其特征在于,步骤(2)中荧光定量PCR反应程序为:95℃预变性2min;95℃15s,60℃30s40个循环;当荧光基团选择FAM时在60℃30s时采集荧光信号。

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