[发明专利]一种真菌种属PCR鉴定方法在审
| 申请号: | 201510801153.0 | 申请日: | 2015-11-19 |
| 公开(公告)号: | CN105567800A | 公开(公告)日: | 2016-05-11 |
| 发明(设计)人: | 赵玉簪 | 申请(专利权)人: | 英格尔检测技术服务(上海)有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
| 代理公司: | 上海三和万国知识产权代理事务所(普通合伙) 31230 | 代理人: | 陈伟勇 |
| 地址: | 201109 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 真菌 种属 pcr 鉴定 方法 | ||
1.一种真菌种属PCR鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤一, 菌株的培养与收集;
步骤二,DNA提取;
步骤三,DNA样品的检测;
步骤四,PCR扩增;
步骤五,测序;
步骤六,序列分析。
2.根据权利要求1所述的一种真菌种属PCR鉴定方法,其特征在于:所 述菌株在一土豆培养基中进行培养,培养环境在25℃~30℃,光照12h,黑暗 12h,培养2~5天后,所述菌株的菌丝长满所述土豆培养基的表面,直接从所 述土豆培养基表面刮取所述菌丝作为样品;
所述土豆培养基是一固体培养基。
3.根据权利要求1所述的一种真菌种属PCR鉴定方法,其特征在于:所 述步骤一中,所述菌株在一土豆培养基中进行培养,培养环境在25℃~30℃, 光照12h,黑暗12h,培养2~5天后,所述菌株的菌丝长满所述土豆培养基的 表面;
将菌丝置于一液体土豆培养基中,保持所述液体土豆培养基内的环境在 25℃~30℃,将所述液体土豆培养基以180r/min的速度进行高速离心5~10天, 再收集菌丝作为样品。
4.根据权利要求2或3所述的一种真菌种属PCR鉴定方法,其特征在于: 步骤2-1,将所述样品溶解在锥形瓶中形成菌液,抽取1ml~2ml所述菌液于一 第一离心管中,将所述第一离心管以12000r/min离心3min~5min;
步骤2-2,在所述第一离心管中加入500μL十六烷基三甲基溴化铵,将 所述第一离心管放入液氮中迅速制冷30s~40s,在将所述第一离心管迅速放入 60℃~70℃温水中30s~40s,重复步骤2-2三~五次;
步骤2-3,在所述第一离心管中再加入所述第一离心管体积1/3的玻璃珠, 将所述第一离心管放置在一漩涡振荡器进行高速震荡3min~8min;
步骤2-4在所述第一离心管中再加入蛋白酶K,将所述第一离心管在60 ℃~65℃的水中保温30min并且每隔10min摇匀1次。
5.根据权利要求4所述的一种真菌种属PCR鉴定方法,其特征在于:步 骤2-5在所述第一离心管中加入体积比在20~30:20~25:0.5~1之间的酚、氯仿 和异戊醇;
步骤2-6将所述第一离心管中的上清液移入到第二离心管中,在所述第二 离心管中加入体积比24:1的氯仿和异戊醇,将所述第二离心管以12000r/min 离心10~12min;
步骤2-7在所述第二离心管内加入比所述上清液体积大两倍的无水乙醇, 所述无水乙醇是预冷过的无水乙醇,将所述第二离心管放在-20℃的环境中静 置20min-30min并且以12000r/min离心10min~15min。
6.根据权利要求5所述的一种真菌种属PCR鉴定方法,其特征在于:步 骤2-8将所述第二离心管内的上清液倒掉留下沉淀,在所述沉淀中加70%的 酒精200μL,再将沉淀在室温中进行干燥;
步骤2-9在所述沉淀中加入100μL的TE缓冲液;
步骤2-10在所述沉淀中加入浓度在10~12mg/mL的核糖核酸酶,在65℃ 环境下保温30min~50min;
步骤2-11,重复步骤2-7~2-9,最后使所述沉淀中的DNA物质溶于50 μL的双蒸水中。
7.根据权利要求6所述的一种真菌种属PCR鉴定方法,其特征在于:所 述DNA物质溶于50μL的双蒸水形成DNA溶液,取5μLDNA溶液置于质 量分数为2%的琼脂糖凝胶中,在电泳缓冲液为1×TBE,电压为120V的条 件下电泳40min,用GoldView染色,在凝胶成像仪上观察DNA分子的大小、 完整性及电泳条带的清晰度,进行拍照。
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