[发明专利]一种真菌种属PCR鉴定方法在审

专利信息
申请号: 201510801153.0 申请日: 2015-11-19
公开(公告)号: CN105567800A 公开(公告)日: 2016-05-11
发明(设计)人: 赵玉簪 申请(专利权)人: 英格尔检测技术服务(上海)有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/04
代理公司: 上海三和万国知识产权代理事务所(普通合伙) 31230 代理人: 陈伟勇
地址: 201109 上*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 真菌 种属 pcr 鉴定 方法
【权利要求书】:

1.一种真菌种属PCR鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤一, 菌株的培养与收集;

步骤二,DNA提取;

步骤三,DNA样品的检测;

步骤四,PCR扩增;

步骤五,测序;

步骤六,序列分析。

2.根据权利要求1所述的一种真菌种属PCR鉴定方法,其特征在于:所 述菌株在一土豆培养基中进行培养,培养环境在25℃~30℃,光照12h,黑暗 12h,培养2~5天后,所述菌株的菌丝长满所述土豆培养基的表面,直接从所 述土豆培养基表面刮取所述菌丝作为样品;

所述土豆培养基是一固体培养基。

3.根据权利要求1所述的一种真菌种属PCR鉴定方法,其特征在于:所 述步骤一中,所述菌株在一土豆培养基中进行培养,培养环境在25℃~30℃, 光照12h,黑暗12h,培养2~5天后,所述菌株的菌丝长满所述土豆培养基的 表面;

将菌丝置于一液体土豆培养基中,保持所述液体土豆培养基内的环境在 25℃~30℃,将所述液体土豆培养基以180r/min的速度进行高速离心5~10天, 再收集菌丝作为样品。

4.根据权利要求2或3所述的一种真菌种属PCR鉴定方法,其特征在于: 步骤2-1,将所述样品溶解在锥形瓶中形成菌液,抽取1ml~2ml所述菌液于一 第一离心管中,将所述第一离心管以12000r/min离心3min~5min;

步骤2-2,在所述第一离心管中加入500μL十六烷基三甲基溴化铵,将 所述第一离心管放入液氮中迅速制冷30s~40s,在将所述第一离心管迅速放入 60℃~70℃温水中30s~40s,重复步骤2-2三~五次;

步骤2-3,在所述第一离心管中再加入所述第一离心管体积1/3的玻璃珠, 将所述第一离心管放置在一漩涡振荡器进行高速震荡3min~8min;

步骤2-4在所述第一离心管中再加入蛋白酶K,将所述第一离心管在60 ℃~65℃的水中保温30min并且每隔10min摇匀1次。

5.根据权利要求4所述的一种真菌种属PCR鉴定方法,其特征在于:步 骤2-5在所述第一离心管中加入体积比在20~30:20~25:0.5~1之间的酚、氯仿 和异戊醇;

步骤2-6将所述第一离心管中的上清液移入到第二离心管中,在所述第二 离心管中加入体积比24:1的氯仿和异戊醇,将所述第二离心管以12000r/min 离心10~12min;

步骤2-7在所述第二离心管内加入比所述上清液体积大两倍的无水乙醇, 所述无水乙醇是预冷过的无水乙醇,将所述第二离心管放在-20℃的环境中静 置20min-30min并且以12000r/min离心10min~15min。

6.根据权利要求5所述的一种真菌种属PCR鉴定方法,其特征在于:步 骤2-8将所述第二离心管内的上清液倒掉留下沉淀,在所述沉淀中加70%的 酒精200μL,再将沉淀在室温中进行干燥;

步骤2-9在所述沉淀中加入100μL的TE缓冲液;

步骤2-10在所述沉淀中加入浓度在10~12mg/mL的核糖核酸酶,在65℃ 环境下保温30min~50min;

步骤2-11,重复步骤2-7~2-9,最后使所述沉淀中的DNA物质溶于50 μL的双蒸水中。

7.根据权利要求6所述的一种真菌种属PCR鉴定方法,其特征在于:所 述DNA物质溶于50μL的双蒸水形成DNA溶液,取5μLDNA溶液置于质 量分数为2%的琼脂糖凝胶中,在电泳缓冲液为1×TBE,电压为120V的条 件下电泳40min,用GoldView染色,在凝胶成像仪上观察DNA分子的大小、 完整性及电泳条带的清晰度,进行拍照。

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