[发明专利]一组核苷酸序列及在沙门菌和志贺菌检测中的应用在审
| 申请号: | 201510792208.6 | 申请日: | 2015-11-17 |
| 公开(公告)号: | CN105219772A | 公开(公告)日: | 2016-01-06 |
| 发明(设计)人: | 叶长芸;王毅;王艳 | 申请(专利权)人: | 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 |
| 主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68;C12Q1/04 |
| 代理公司: | 北京市众天律师事务所 11478 | 代理人: | 李新军 |
| 地址: | 102206 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一组 核苷酸 序列 沙门 志贺菌 检测 中的 应用 | ||
1.一组用于MERT-LAMP扩增的引物序列,其特征在于,所述序列包括:SEQIDNO:1所示的引物Sal-F3,SEQIDNO:2所示的引物Sal-B3,SEQIDNO:4所示的引物Sal-EFIP,SEQIDNO:5所示的引物Sal-BIP,SEQIDNO:6所示的引物Sal-LF,SEQIDNO:7所示的引物Sal-LB;和/或
SEQIDNO:8所示的引物Shi-F3,SEQIDNO:9所示的引物Shi-B3,SEQIDNO:11所示的引物Shi-EFIP,SEQIDNO:12所示的引物Shi-BIP,SEQIDNO:13所示的引物Shi-LF,SEQIDNO:14所示的引物Shi-LB,
其中,在引物Sal-EFIP和引物Shi-EFIP的5’端各标记有一个彼此不同的荧光基团,并在所述引物的其它位置标记有一荧光猝灭基团。
2.根据权利要求1所述的序列,其特征在于,所述序列还包括SEQIDNO:3所示的引物Sal-FIP,和/或SEQIDNO:10所示的引物Shi-FIP。
3.根据权利要求2所述的序列,其特征在于,引物Sal-EFIP标记的荧光基团为HEX,所述Shi-EFIP标记的荧光基团为Cy5。
4.根据权利要求3所述的序列,其特征在于,所述引物Sal-EFIP标记的荧光猝灭基团为BHQ-1,所述Shi-EFIP标记的荧光猝灭基团为BHQ-2。
5.根据权利要求4所述的序列,其特征在于,所述引物Sal-EFIP的荧光猝灭基团标记位置位于5’端第16碱基,所述引物Shi--EFIP的荧光猝灭基团标记位置位于5’端第21碱基。
6.根据权利要求1-5中任一所述的序列在沙门菌和/或志贺菌检测中的应用,所述检测采用MERT-LAMP扩增技术。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述MERT-LAMP扩增的反应温度为62-65℃。
8.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述应用采用单一样本检测模式,所使用的引物为:
SEQIDNO:1所示的引物Sal-F3,SEQIDNO:2所示的引物Sal-B3,SEQIDNO:4所示的引物Sal-EFIP,SEQIDNO:5所示的引物Sal-BIP,SEQIDNO:6所示的引物Sal-LF,SEQIDNO:7所示的引物Sal-LB;或
SEQIDNO:8所示的引物Shi-F3,SEQIDNO:9所示的引物Shi-B3,SEQIDNO:11所示的引物Shi-EFIP,SEQIDNO:12所示的引物Shi-BIP,SEQIDNO:13所示的引物Shi-LF,SEQIDNO:14所示的引物Shi-LB。
9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,所述序列还包括SEQIDNO:3所示的引物Sal-FIP,或SEQIDNO:10所示的引物Shi-FIP。
10.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述应用采用多重样本检测模式,所使用的引物为:
SEQIDNO:1所示的引物Sal-F3,SEQIDNO:2所示的引物Sal-B3,SEQIDNO:4所示的引物Sal-EFIP,SEQIDNO:5所示的引物Sal-BIP,SEQIDNO:6所示的引物Sal-LF,SEQIDNO:7所示的引物Sal-LB;和
SEQIDNO:8所示的引物Shi-F3,SEQIDNO:9所示的引物Shi-B3,SEQIDNO:11所示的引物Shi-EFIP,SEQIDNO:12所示的引物Shi-BIP,SEQIDNO:13所示的引物Shi-LF,SEQIDNO:14所示的引物Shi-LB。
11.根据权利要求10所述的应用,其特征在于,所述序列还包括SEQIDNO:3所示的引物Sal-FIP,和SEQIDNO:10所示的引物Shi-FIP。
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