[发明专利]基于竞争性等位基因特异性PCR技术的FLC1特异SNP分子标记及应用在审
| 申请号: | 201510769744.4 | 申请日: | 2015-11-11 |
| 公开(公告)号: | CN105238869A | 公开(公告)日: | 2016-01-13 |
| 发明(设计)人: | 苏同兵;于拴仓;张凤兰;余阳俊;赵岫云;张德双;卢桂香;隋光磊 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;白艳 |
| 地址: | 100097 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 竞争性 等位基因 特异性 pcr 技术 flc1 特异 snp 分子 标记 应用 | ||
1.检测白菜基因组中FLC1-13859895G/ASNP位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定白菜的抽薹状态中的应用;
或检测白菜基因组中FLC1-13859895G/ASNP位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定白菜的抽薹状态产品中的应用。
2.检测白菜基因组中FLC1-13859895G/ASNP位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定白菜为早抽薹白菜或晚抽薹白菜中的应用;
或检测白菜基因组中FLC1-13859895G/ASNP位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定白菜为早抽薹白菜或晚抽薹白菜产品中的应用。
3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于:所述检测白菜基因组中FLC1-13859895G/ASNP位点的多态性或基因型的物质包括由序列1所示的单链DNA分子、序列2所示的单链DNA分子和序列3所示的单链DNA分子组成的引物组。
4.一种鉴定或辅助鉴定待测白菜为早抽薹白菜或晚抽薹白菜品种的方法,包括如下步骤:检测待测白菜基因组FLC1-13859895G/ASNP位点基因型为AA、GG或GA,若所述待测白菜基因组FLC1-13859895G/ASNP位点基因型为AA,则所述待测白菜为或候选为早抽薹白菜;若所述待测白菜基因组FLC1-13859895G/ASNP位点基因型为GG或GA,则所述待测白菜为或候选为晚抽薹白菜。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:所述检测待测白菜基因组FLC1-13859895G/ASNP位点基因型的方法为如下:
1)直接测序;
2)用引物对待测白菜进行等位基因特异性PCR;
所述引物由序列1所示的单链DNA分子、序列2所示的单链DNA分子和序列3所示的单链DNA分子组成。
6.根据权利要求1-5中任一所述的应用,其特征在于:所述FLC1-13859895G/ASNP位点为序列表中序列4中第182位核苷酸。
7.鉴定或辅助鉴定待测白菜抽薹的引物,由序列1所示的单链DNA分子、序列2所示的单链DNA分子和序列3所示的单链DNA分子组成。
8.鉴定或辅助鉴定待测白菜抽薹的PCR试剂,为含有权利要求7所述的引物的PCR试剂;所述引物中的每条引物在所述PCR试剂中的终浓度均为10μM。
9.鉴定或辅助鉴定待测白菜抽薹的试剂盒,为含有权利要求7所述的引物或权利要求8所述的试剂盒。
10.一种鉴定或辅助鉴定待测白菜为早抽薹白菜或晚抽薹白菜品种的方法,包括如下步骤:用权利要求7所述的引物对待测引物进行等位基因特异性PCR,若所述待测白菜基因组FLC1-13859895G/ASNP位点基因型为AA,则待测白菜为或候选为早抽薹白菜;若所述待测白菜基因组FLC1-13859895G/ASNP位点基因型为GG或G/A,则待测白菜为或候选为晚抽薹白菜;
所述等位基因特异性PCR的模板具体为待测白菜的基因组DNA。
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