[发明专利]一种用于检测PRRSV欧洲株的Taqman Real-time RT-PCR试剂盒及其使用方法在审
申请号: | 201510719384.7 | 申请日: | 2015-10-30 |
公开(公告)号: | CN105274255A | 公开(公告)日: | 2016-01-27 |
发明(设计)人: | 吴锦艳;田宏;尚佑军;陈妍;王光祥;刘湘涛;张志东;栾志舫;臧金凤;王耀杰 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院兰州兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
代理公司: | 甘肃省知识产权事务中心 62100 | 代理人: | 鲜林 |
地址: | 730046 甘肃*** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 prrsv 欧洲 taqman real time rt pcr 试剂盒 及其 | ||
1.一种用于检测PRRSV欧洲株的TaqmanReal-timeRT-PCR试剂盒,包括OneStepRT-PCRbuffer、酶混合物、阳性对照、无RNA酶水、序列SEQIDNO:1至SEQIDNO:2的引物及SEQIDNO:3的探针引物的混合物,其特征在于:所述序列SEQIDNO:1至SEQIDNO:2的引物序列为:
SEQIDNO:1:上游引物AGGAAGAACCGAGCTAGTGACAAT;
SEQIDNO:2:下游引物CATAAGGCGCTGGCTGATAGACC。
2.根据权利要求1所述的一种用于检测PRRSV欧洲株的TaqmanReal-timeRT-PCR试剂盒,其特征在于所述探针引物序列为:
SEQIDNO:3:GCCGGCCTGAAGCAACTGGTGG。
3.根据权利要求1所述的PRRSV欧洲株的TaqmanReal-timeRT-PCR试剂盒,其特征在于所述探针引物混合物扩增出的条带序列为:
SEQIDNO:1至SEQIDNO:2的由5’端向3’端延长的序列:
SEQIDNO:4:
aggaagaaccgagctagtgacaatgccggcctgaagcaactggtggcacagtgggataggaaattgagtgtgaccccccccccaaaaccggttgggccagtgcttgaccagatcgtccctccgcctacggatatccagcaagaagatgtcaccccctccgatgggccaccccatgcgccggattttcctagtcgagtgagcacgggcgggagttggaaaggccttatgctttccggcacc
cgtctcgcggggtctatcagccagcgccttatg。
4.根据权利要求1、2或3所述的一种用于检测PRRSV欧洲株的TaqmanReal-timeRT-PCR试剂盒,其特征在于所述扩增引物及探针引物SEQIDNO:1、SEQIDNO:2、SEQIDNO:3的引物浓度均为10pmol/μL,引物体积配比为1:1:1。
5.根据权利要求1所述的一种用于检测PRRSV欧洲株的TaqmanReal-timeRT-PCR试剂盒,其特征在于所述阳性对照为构建的pGM-273阳性质粒以及利用其倍比稀释后制作为标准曲线。
6.一种如权利要求1所述检测PRRSV欧洲株的TaqmanReal-timeRT-PCR试剂盒的使用方法,包括以下步骤:
a.使用权利要求1所述的检测试剂盒进行RT-PCR扩增,条件如下:42℃反转录5min;94℃预变性2min;94℃20s,退火温度52℃30s,72℃20s,40个循环;
b.结果分析
根据扩增结果判定:在NTC没有Ct值的情况下,Ct值<35判为阳性;Ct值介于35-40为可疑,需重复检测;再次测定时该样品Ct值<35为阳性,Ct值≥35为阴性;也可以依扩增得到的Ct值根据标准曲线对样品进行准确定量。
7.根据权利要求6所述检测PRRSV欧洲株的TaqmanReal-timeRT-PCR试剂盒的使用方法,其特征在于所述使用试剂盒中的试剂制备荧光定量RT-PCR的反应体系为:
a.OneStepRT-PCRbuffer:12.5份;
b.引物混合液3份;
c.酶混合物1份;
d.无RNA/DNA酶水5.5份;
e.提取样品的RNA模板3份;
f.阳性对照pGM-273阳性质粒3份;
g.阴性对照无RNA/DNA酶水3份。
8.根据权利要求7所述检测PRRSV欧洲株的TaqmanReal-timeRT-PCR试剂盒的使用方法,其特征在于所述反应体系中的引物混合液3份为引物浓度为10pmol/μl的三条引物混合液,其中273bp上游引物1份,273bp下游引物1份,探针引物1份。
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