[发明专利]一种与非甾体类消炎药预防结直肠癌相关的SNP标志物及其应用有效
| 申请号: | 201510679710.6 | 申请日: | 2015-10-19 |
| 公开(公告)号: | CN105274222B | 公开(公告)日: | 2018-12-07 |
| 发明(设计)人: | 王一雄;江玥;戴俊程;李绵;丁舒丹 | 申请(专利权)人: | 南京亿科人群健康研究院有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
| 代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 刘成群;徐冬涛 |
| 地址: | 210000 江苏省南京市江北*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 非甾体类 消炎药 预防 直肠癌 相关 snp 标志 及其 应用 | ||
1.一种与非甾体类消炎药预防结直肠癌相关的SNP标志物,该标志物为rs12217975,rs1927466,rs7586006,rs17868336,rs1500482,rs16973225,rs10505806,rs6717546,rs2965667,rs73172231,rs16825767,rs1902023,rs2745559,rs73172243,rs2920421的组合。
2.根据权利要求1所述SNP标志物的特异性引物,包括特异性扩增引物和特异性延伸引物,其特征在于该扩增引物为:
rs12217975的引物序列为SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2;
rs1927466的引物序列为SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5;
rs7586006的引物序列为SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8;
rs17868336的引物序列为SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11;
rs1500482的引物序列为SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14;
rs16973225的引物序列为SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17;
rs10505806的引物序列为SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20;
rs6717546的引物序列为SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23;
rs2965667的引物序列为SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26;
rs73172231的引物序列为SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29;
rs16825767的引物序列为SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:32;
rs1902023的引物序列为SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35;
rs2745559的引物序列为SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38;
rs73172243的引物序列为SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41;
rs2920421的引物序列为SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44;
该特异性延伸引物为:
rs12217975的引物序列为SEQ ID NO:3;
rs1927466的引物序列为SEQ ID NO:6;
rs7586006的引物序列为SEQ ID NO:9;
rs17868336的引物序列为SEQ ID NO:12;
rs1500482的引物序列为SEQ ID NO:15;
rs16973225的引物序列为SEQ ID NO:18;
rs10505806的引物序列为SEQ ID NO:21;
rs6717546的引物序列为SEQ ID NO:24;
rs2965667的引物序列为SEQ ID NO:27;
rs73172231的引物序列为SEQ ID NO:30;
rs16825767的引物序列为SEQ ID NO:33;
rs1902023的引物序列为SEQ ID NO:36;
rs2745559的引物序列为SEQ ID NO:39;
rs73172243的引物序列为SEQ ID NO:42;
rs2920421的引物序列为SEQ ID NO:45。
3.权利要求2所述的特异性扩增引物和特异性延伸引物在制备与非甾体类消炎药预防结直肠癌相关的辅助诊断试剂盒中的应用。
4.一种与非甾体类消炎药预防结直肠癌相关的辅助诊断试剂盒,其特征在于该试剂盒用于检测外周血DNA中rs12217975,rs1927466,rs7586006,rs17868336,rs1500482,rs16973225,rs10505806,rs6717546,rs2965667,rs73172231,rs16825767,rs1902023,rs2745559,rs73172243,rs2920421的SNP标志物组合,含有权利要求2所述的特异性扩增引物和特异性延伸引物。
5.根据权利要求4所述的非甾体类消炎药预防结直肠癌相关的辅助诊断剂盒,其特征在于该试剂盒还包括PCR技术常用的试剂。
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