[发明专利]焦磷酸测序法检测CYP2C9基因分型的引物对及试剂盒在审
申请号: | 201510675176.1 | 申请日: | 2015-10-18 |
公开(公告)号: | CN105368826A | 公开(公告)日: | 2016-03-02 |
发明(设计)人: | 滕祥云;黄少亚 | 申请(专利权)人: | 长沙三济生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 410013 湖南省长沙市*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 磷酸 测序法 检测 cyp2c9 基因 引物 试剂盒 | ||
1.一种焦磷酸测序法检测CYP2C9基因分型的引物对,其特征 在于,所述CYP2C9基因检测的多态性位点为CYP2C9*2和/或 CYP2C9*3,所述引物对包括:
(1)对于CYP2C9*2等位基因,
扩增引物为:
CYP2C9*2正向扩增引物:5’-GACGCTGCGGAATTTTGG-3’;
CYP2C9*2反向扩增引物:
5’-CAGTAAGGTCAGTGATATGGAGTAGGG-3’;
CYP2C9*2测序引物:5’-GGCTTCCTCTTGAACA-3’;
其中,所述CYP2C9*2正向扩增引物的5’端进行生物素标记;
(2)对于CYP2C9*3等位基因,
扩增引物为:
CYP2C9*3正向扩增引物:5’-AGCCACATGCCCTACACAG-3’;
CYP2C9*3反向扩增引物:5’-CAGGCTGGTGGGGAGAAG-3’;
CYP2C9*3测序引物:5’-GCACGAGGTCCAGAGA-3’;
其中,所述CYP2C9*3反向扩增引物的5’端进行生物素标记。
2.一种焦磷酸测序法检测CYP2C9基因分型的试剂盒,其特征 在于,所述CYP2C9基因检测的多态性位点为CYP2C9*2和/或 CYP2C9*3,所述试剂盒包括:
(1)对于CYP2C9*2等位基因,
CYP2C9*2正向扩增引物:5’-GACGCTGCGGAATTTTGG-3’;
PCR反应液1,所述PCR反应液1含有CYP2C9*2反向扩增引 物:5’-CAGTAAGGTCAGTGATATGGAGTAGGG-3’;
CYP2C9*2测序引物:5’-GGCTTCCTCTTGAACA-3’;
其中,所述CYP2C9*2正向扩增引物的5’端进行生物素标记;
(2)对于CYP2C9*3等位基因,
CYP2C9*3反向扩增引物:5’-CAGGCTGGTGGGGAGAAG-3’;
PCR反应液2,所述PCR反应液2含有CYP2C9*3正向扩增引 物:5’-AGCCACATGCCCTACACAG-3’;
CYP2C9*3测序引物:5’-GCACGAGGTCCAGAGA-3’;
其中,所述CYP2C9*3反向扩增引物的5’端进行生物素标记。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还 包括:
CYP2C9*2阳性对照品1,其为插有SEQIDNO.8所示核苷酸序 列的CYP2C9*2野生纯合子质粒;
CYP2C9*2阳性对照品2,其为所述CYP2C9*2野生纯合子质粒 与插有SEQIDNO.9所示核苷酸序列的CYP2C9*2突变纯合子质粒 组成的质粒混合物;
CYP2C*3阳性对照品1,其为插有SEQIDNO.10所示核苷酸序 列的CYP2C9*3野生纯合子质粒;
CYP2C*3阳性对照品2,其为所述CYP2C9*3野生纯合子质粒 与插有SEQIDNO.11所示核苷酸序列的CYP2C9*3突变纯合子质粒 组成的质粒混合物;
其中,质粒载体为pMD18-T质粒。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述CYP2C9*2 阳性对照品2中所述CYP2C9*2突变纯合子质粒和所述CYP2C9*2 野生纯合子质粒的数量比为1:1;所述CYP2C9*3阳性对照品2中所 述CYP2C9*3突变纯合子质粒和所述CYP2C9*3野生纯合子质粒的 数量比为1:1。
5.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还 包括:质控品和空白对照品,所述质控品的序列为:TAYGGTTTGCA。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述空白对照 品为水。
7.权利要求1所述的引物对在制备用于检测CYP2C9基因分型 的试剂中的应用。
8.权利要求2所述的试剂盒在制备用于检测CYP2C9基因分型 的试剂中的应用。
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