[发明专利]基于Sanger测序灵敏检测人类EGFR基因突变的方法及其试剂盒有效
申请号: | 201510666246.7 | 申请日: | 2015-10-16 |
公开(公告)号: | CN105256021B | 公开(公告)日: | 2018-07-24 |
发明(设计)人: | 黄志清;施纯玫;郑建伟;陈强;翁芳霞;王劲 | 申请(专利权)人: | 福建医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350005 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 突变 试剂盒 人类EGFR基因 灵敏检测 野生型 样本 基因突变检测 含量样品 扩增片段 扩增体系 突变检测 突变片段 突变位点 杂合基因 耐热DNA 连接酶 检测 准确率 扩增 条带 引物 判定 引入 保证 | ||
1.一种基于Sanger测序灵敏检测人类EGFR基因突变的引物,其特征在于:所述引物由扩增引物组和连接引物组组成,所述连接引物组的核苷酸序列如SEQ.ID NO.9- SEQ.IDNO.26所示,所述引物必须同耐热DNA酶在同一反应体系下共同使用。
2.一种基于Sanger测序灵敏检测人类EGFR基因突变的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒是在EGFR基因片段扩增体系中加入了如权利要求1所述的连接引物组、耐热DNA连接酶及其缓冲液。
3.根据权利要求2所述的基于Sanger测序灵敏检测人类EGFR基因突变的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括DNA聚合酶、PCR缓冲液、dNTPs、8条扩增引物、18条连接引物、耐热DNA连接酶和耐热DNA连接酶缓冲液;所述8条扩增引物其序列如SEQ.ID NO.1- SEQ.IDNO.8所示,其中SEQ.ID NO.1和SEQ.ID NO.2、SEQ.ID NO.3和SEQ.ID NO.4 、SEQ.ID NO.5和SEQ.ID NO.6、SEQ.ID NO.7和SEQ.ID NO.8分别用于靶向第18、19、20、21号外显子片段的扩增;所述18条连接引物其序列如SEQ.ID NO.9- SEQ.ID NO.26所示,其中SEQ.ID NO.9和SEQ.ID NO.10靶向第18号外显子的3种突变位点,SEQ.ID NO.11和SEQ.ID NO.12靶向第19号外显子的19种突变位点,SEQ.ID NO.13-SEQ.ID NO.22靶向第20号外显子的5种突变位点,SEQ.ID NO.23-SEQ.ID NO.26靶向第21号外显子的2种突变位点。
4.根据权利要求3所述的基于Sanger测序灵敏检测人类EGFR基因突变的试剂盒,其特征在于:所述DNA聚合酶的酶活力单位浓度为5 U/μL ,具有耐热性能;所述PCR缓冲液是由pH=8.3的100mmol/L Tris-HCl、500mmol/L KCl和15mmol/L MgCl2组成;所述dNTPs是由dATP、dTTP、dCTP和dGTP各2.5mmol/L混合而成的;所述扩增引物的浓度均为10μmol/L ;所述连接引物的浓度均为10μmol/L ;所述耐热DNA连接酶的酶活力单位浓度不低于4000 U/μL ,在正常体系下95度保温1h酶活力不低于原酶活的60%;所述耐热DNA连接酶缓冲液的配制为20 mM Tris-HCl、25 mM 乙酸钾、10 mM 乙酸镁、1 mM NAD、10 mM DTT、0.1% TritonX-100,pH=7.6。
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