[发明专利]一种基于链置换放大和DNAzyme放大的检测DNA甲基转移酶活性的方法有效
| 申请号: | 201510595903.3 | 申请日: | 2015-09-17 |
| 公开(公告)号: | CN105112540B | 公开(公告)日: | 2019-03-05 |
| 发明(设计)人: | 姜玮;王磊;崔万玲 | 申请(专利权)人: | 山东大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/6818;C12Q1/48 |
| 代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 张勇 |
| 地址: | 250061 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 置换 放大 dnazyme 检测 dna 甲基转移酶 活性 方法 | ||
1.一种非疾病诊断治疗目的的检测DNA甲基转移酶活性的方法,通过链置换反应放大和8-17 DNAzyme放大DNA甲基转移酶的识别信号;DNA甲基转移酶的作用使得限制性内切酶无法切割探针序列,探针序列通过切割酶依赖的链置换反应扩增出8-17 DNAzyme,进行信号一级放大;8-17 DNAzyme催化分子信标裂分释放荧光信号,并重新释放8-17 DNAzyme,进行信号的二级放大;缺少DNA甲基转移酶时,探针序列被限制性内切酶切割,无法进行切割酶依赖的链置换反应,其特征在于所用DNA探针为三功能双链DNA探针,包含用于合成8-17DNAzyme的原料8-17 DNAzyme,检测过程包括如下步骤:
(1)制备用于进行链置换反应的三功能双链DNA探针,探针包括杂交双链部分和悬垂单链部分,杂交双链部分含有DNA甲基转移酶识别位点,和包含该位点的限制性内切酶的识别位点,垂悬单链部分包括链置换反应切割酶识别的切割位点、用于合成8-17 DNAzyme的8-17 DNAzyme互补序列;所述三功能双链DNA探针由两条单链P1和P2退火形成,P1序列对应三功能双链DNA探针的杂交双链部分序列,P1为包括DNA甲基转移酶识别位点的单链,DNA甲基转移酶识别位点区域可被限制性内切酶识别,P2序列按3′-5′顺序依次为P1互补序列、链置换反应切割酶识别的切割位点、用于合成8-17 DNAzyme的8-17 DNAzyme互补序列;
(2)加入步骤(1)探针所对应的DNA甲基转移酶孵育,然后加入步骤(1)探针所对应的限制性内切酶进行反应;
(3)对步骤(2)反应获得体系进行酶灭活,然后进行切割酶依赖的链置换反应,扩增8-17 DNAzyme;
(4)加入8-17 DNAzyme识别的分子信标,进行信号检测。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,三功能双链DNA探针的杂交双链部分中P1的DNA甲基转移酶识别位点与3’端间的区域为2-7个碱基的抑制区域。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述抑制区域的碱基为5个。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,分子信标为具有茎环结构的分子信标,其两端分别标记有荧光基团和猝灭基团,与8-17 DNAzyme杂交,从而引发自身二级裂分,释放荧光信号。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,P1序列为SEQ ID NO:1所示,P2序列为SEQID NO:2所示,DNA甲基转移酶为M.SssI,所对应的限制性内切酶为HpaII。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,分子信标的序列为SEQ ID NO:4所示。
7.一种利用权利要求1-6任一项所述方法进行DNA甲基化转移酶抑制剂/拮抗剂筛选的方法,其特征在于:在步骤(2)中,在加入DNA甲基化转移酶之前,加入不同浓度的候选抑制剂,进行孵育。
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