[发明专利]一种定量检测DNA双链断裂碎片数的标准品的制备方法及应用有效
| 申请号: | 201510521924.0 | 申请日: | 2015-08-24 |
| 公开(公告)号: | CN105177128B | 公开(公告)日: | 2019-01-25 |
| 发明(设计)人: | 徐克前;邓爽;阎祖炜;朱燕;王雷;李鹏 | 申请(专利权)人: | 中南大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;C12P19/34 |
| 代理公司: | 长沙市融智专利事务所 43114 | 代理人: | 袁靖 |
| 地址: | 410083 湖南*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 定量 检测 dna 断裂 碎片 标准 制备 方法 应用 | ||
1.一种定量检测精子DNA双链断裂碎片数的标准品的制备方法,其特征在于,用限制性内切酶PmeI, EcoRV, PsiI, SspI, HaeⅢ, AluI分别完全酶切已知序列的基因或基因组DNA所得碎片即为标准品;所述的标准品要满足以下条件:
用于制备标准品的对象为完整基因或基因组,即DNA双链断裂阴性标本,要求出现DNA双链断裂的比例<5%;
能够利用所述的标准品采用标准曲线法对待测样品进行DNA双链断裂碎片数的定量分析,所述的标准品与待测样品的DNA类型相同。
2.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,采用连接介导荧光定量PCR进行标准品扩增制备标准曲线。
3.根据权利要求2所述的制备方法,其特征在于,标准曲线以进行连接介导荧光定量PCR后的标准品的Ct值为横坐标,DNA双链断裂碎片数为纵坐标,通过曲线拟合获得拟合方程。
4.根据权利要求3所述的制备方法,其特征在于,对于任何已知DNA序列的基因或基因组进行序列扫描,计算出基因或基因组中限制性内切酶特异识别序列出现的次数,1个特异识别序列即为1个切割位点,从而计算限制性内切酶在基因或基因组中的切割位点数,得到标准品基因或基因组DNA双链断裂碎片数。
5.根据权利要求3所述的制备方法,其特征在于,待测样品同样采用连接介导荧光定量PCR法扩增,将待测样本的Ct值代入方程中即换算得到DNA双链断裂碎片数值。
6.权利要求2-5任一项所述的方法制备得到的标准品在制备定量检测精子DNA双链断裂片段数的制剂中的应用,其特征在于,所述的制剂用于对待测样品进行DNA双链断裂碎片数的定量分析。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,利用所述的标准品采用标准曲线法对待测样品进行DNA双链断裂碎片数的定量分析。
8.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述的标准品与待测样品的DNA类型相同。
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