[发明专利]一种GII.4型诺如病毒基因组扩增引物和扩增方法有效
申请号: | 201510487540.1 | 申请日: | 2015-08-10 |
公开(公告)号: | CN105039330B | 公开(公告)日: | 2018-04-03 |
发明(设计)人: | 薛亮;吴清平;蔡伟程;寇晓霞;张菊梅 | 申请(专利权)人: | 广东省微生物研究所;广东环凯微生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12N15/10 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司44001 | 代理人: | 刘明星 |
地址: | 510070 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 gii 型诺如 病毒 基因组 扩增 引物 方法 | ||
1.一种GII.4型诺如病毒基因组扩增引物,其特征在于,包括六对扩增引物:
引物对1:P1F:5'-GTGAATGAAGATGGCGTCTAAC-3';
P1596R:5'-TCGACGCCATTGCGTGGGA-3';
引物对2:P1258F:5'-CAACCATATGACCACCTTGCT-3';
P2805R:5'-ATGGCCACCTCCTCATAGTA-3';
引物对3:P2689F:5'-AGGTCTCAGTGATGAAGAG-3';
P4248R:5'-GGGCCATCCTCATTCATATTCA-3';
引物对4:P4099F:5'-TGGTAAGATCAAGAAGAGGCT-3';
G2SKR:5'-CCRCCNGCATRHCCRTTRTACAT-3';
引物对5:NV2of2:5'-GGAGGGCGATCGCAATC-3';
GV132:5'-CCRGCRAAGAAAGCTCCAGCCAT-3';
引物对6:P6484F:5'-CAGCACAATCTGATGTGGC-3';
P7513R:5'-TTACACCCGTGACTCCCCT-3'。
2.一种GII.4型诺如病毒基因组的扩增方法,其特征在于,分别以权利要求1所述的引物对P1F/P1596R、P1258F/P2805R、P2689F/P4248R、P4099F/G2SKR、NV2of2/GV132和P6484F/P7513R作为扩增引物的上下游引物,以GII.4型诺如病毒的RNA为模板进行RT-PCR扩增,分别得到扩增产物,然后对扩增产物进行核酸序列测序,然后再拼接比对,得到GII.4型诺如病毒基因组全长序列。
3.根据权利要求2所述的扩增方法,其特征在于,所述的RT-PCR,其反应体系为:含有2×one-step RT-PCR mixture 10μL,10μmol/L上游引物和10μmol/L下游引物各0.6μL,MLV/RNasin/HS-Taq酶混合液0.8μL,RNA模板2μL,其余由双蒸水补足至20μL,反应条件为:50℃反转录30min,94℃预变性3min,然后94℃30s,55℃30s,72℃80s,共30次循环后,72℃最后延伸7min。
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