[发明专利]一种基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法在审

专利信息
申请号: 201510481558.0 申请日: 2015-08-03
公开(公告)号: CN105018625A 公开(公告)日: 2015-11-04
发明(设计)人: 孙子奎;高文学;丁方美;王峰;方婉 申请(专利权)人: 上海派森诺生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 上海晨皓知识产权代理事务所(普通合伙) 31260 代理人: 成丽杰
地址: 200231 上海市徐汇*** 国省代码: 上海;31
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 一种 基于 序列 通量 检测 肉制品 材料 来源 方法
【权利要求书】:

1.一种基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,包含下述步骤:

(1)提取待测肉制品的基因组DNA;

(2)设计并合成COI通用引物序列,其中,正向引物如SEQ ID NO:1所示,反向引物如SEQ ID NO:2所示;

(3)采用步骤(2)中所述的正向引物和反向引物,以步骤(1)中所提取的基因组DNA为模板进行PCR扩增,然后对PCR产物进行纯化;

(4)对步骤(3)中纯化后PCR产物进行定量,并等量混样,构建标准文库,然后进行高通量测序;

(5)根据步骤(4)中测序的结果,得到待测肉制品的COI序列信息,由此得出待测肉制品的材料来源。

2.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,分别在SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示序列的5’端连接7碱基条形码,得到条形码通用引物,用于所述PCR扩增反应。

3.根据权利要求2所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,所述7碱基条形码的序列为ACACAGT或CAGAGTC。

4.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,所述步骤(3)中进行PCR扩增的反应体系组成为:基因组DNA模板2μl、5U/ul的Q5聚合酶0.25μl、Q5 Reaction Buffer(5×)、Q5 GC high Enhancer(5×)、2.5μM dNTP 2μl、10μM的正向引物1μl、10μM的反向引物1μl,加ddH2O至25μl。

5.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,所述步骤(3)中进行PCR扩增的反应程序为:98℃预变性30s,然后以98℃变性30s、52℃退火30s、72℃延伸30s为一个循环,进行27个循环,最后72℃延伸5min,4℃至无穷。

6.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,所述步骤(3)中采用胶回收试剂盒对PCR产物进行纯化。

7.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,所述步骤(4)中采用美国Biotek FLX800荧光分析仪进行定量。

8.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,所述步骤(4)中采用Illumina文库构建试剂盒进行标准文库的构建。

9.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,所述步骤(4)中采用Illumina MiSeq测序平台进行高通量测序。

10.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,述步骤(5)中根据待测肉制品的COI序列信息得出待测肉制品的材料来源的方法是:将待测肉制品的COI序列信息,与已知物种的COI基因序列进行比对,从而得出待测肉制品的材料来源。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于上海派森诺生物科技有限公司,未经上海派森诺生物科技有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201510481558.0/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top