[发明专利]一种基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法在审
| 申请号: | 201510481558.0 | 申请日: | 2015-08-03 |
| 公开(公告)号: | CN105018625A | 公开(公告)日: | 2015-11-04 |
| 发明(设计)人: | 孙子奎;高文学;丁方美;王峰;方婉 | 申请(专利权)人: | 上海派森诺生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海晨皓知识产权代理事务所(普通合伙) 31260 | 代理人: | 成丽杰 |
| 地址: | 200231 上海市徐汇*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 序列 通量 检测 肉制品 材料 来源 方法 | ||
1.一种基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,包含下述步骤:
(1)提取待测肉制品的基因组DNA;
(2)设计并合成COI通用引物序列,其中,正向引物如SEQ ID NO:1所示,反向引物如SEQ ID NO:2所示;
(3)采用步骤(2)中所述的正向引物和反向引物,以步骤(1)中所提取的基因组DNA为模板进行PCR扩增,然后对PCR产物进行纯化;
(4)对步骤(3)中纯化后PCR产物进行定量,并等量混样,构建标准文库,然后进行高通量测序;
(5)根据步骤(4)中测序的结果,得到待测肉制品的COI序列信息,由此得出待测肉制品的材料来源。
2.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,分别在SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示序列的5’端连接7碱基条形码,得到条形码通用引物,用于所述PCR扩增反应。
3.根据权利要求2所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,所述7碱基条形码的序列为ACACAGT或CAGAGTC。
4.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,所述步骤(3)中进行PCR扩增的反应体系组成为:基因组DNA模板2μl、5U/ul的Q5聚合酶0.25μl、Q5 Reaction Buffer(5×)、Q5 GC high Enhancer(5×)、2.5μM dNTP 2μl、10μM的正向引物1μl、10μM的反向引物1μl,加ddH2O至25μl。
5.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,所述步骤(3)中进行PCR扩增的反应程序为:98℃预变性30s,然后以98℃变性30s、52℃退火30s、72℃延伸30s为一个循环,进行27个循环,最后72℃延伸5min,4℃至无穷。
6.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,所述步骤(3)中采用胶回收试剂盒对PCR产物进行纯化。
7.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,所述步骤(4)中采用美国Biotek FLX800荧光分析仪进行定量。
8.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,所述步骤(4)中采用Illumina文库构建试剂盒进行标准文库的构建。
9.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,所述步骤(4)中采用Illumina MiSeq测序平台进行高通量测序。
10.根据权利要求1所述的基于短序列高通量测序检测肉制品材料来源的方法,其特征在于,述步骤(5)中根据待测肉制品的COI序列信息得出待测肉制品的材料来源的方法是:将待测肉制品的COI序列信息,与已知物种的COI基因序列进行比对,从而得出待测肉制品的材料来源。
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