[发明专利]一种用于快速鉴定腿端黑实蝇的种特异性引物对、试剂盒及鉴定方法有效
| 申请号: | 201510469660.9 | 申请日: | 2015-08-04 |
| 公开(公告)号: | CN105087559B | 公开(公告)日: | 2018-03-06 |
| 发明(设计)人: | 黄振;谢婧;张伟;张旺珍;何末军;吴毅平;陈逸石;陈韶萍;黄可辉 | 申请(专利权)人: | 中华人民共和国福州机场出入境检验检疫局 |
| 主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6888 |
| 代理公司: | 北京市盛峰律师事务所11337 | 代理人: | 席小东 |
| 地址: | 350209 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 快速 鉴定 腿端黑实蝇 特异性 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种用于快速鉴定腿端黑实蝇的种特异性引物对,其特征在于,包括上游引物TF37和下游引物TR480;
所述上游引物TF37的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;
所述下游引物TR480的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。
2.一种用于快速鉴定腿端黑实蝇的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括以下引物:
上游引物TF37,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;
下游引物TR480,其核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。
3.根据权利要求2所述的用于快速鉴定腿端黑实蝇的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括PCR反应缓冲液中的至少一种;所述试剂盒还包括标准阳性模板。
4.一种采用权利要求1所述的种特异性引物对快速鉴定腿端黑实蝇的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1,设计腿端黑实蝇的种特异性引物对;其中,所述腿端黑实蝇的种特异性引物对包括上游引物TF37和下游引物TR480;
其中,上游引物TF37的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;下游引物TR480的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;
S2,提取被鉴定生物体的DNA;
S3,以S2提取的DNA为模板,使用S1得到的所述腿端黑实蝇的种特异性引物对进行SS-PCR扩增反应;
S4,采用电泳检测SS-PCR扩增产物,判断所述SS-PCR扩增产物是否含有444bp的特征条带,如果含有,则所述被鉴定生物体为腿端黑实蝇种;反之,则所述被鉴定生物体不为腿端黑实蝇种。
5.根据权利要求4所述的种特异性引物对快速鉴定腿端黑实蝇的方法,其特征在于,S1中,通过以下方法设计得到腿端黑实蝇的种特异性引物对:
S1.1,选用腿端黑实蝇的标本,采用试剂盒法从所述腿端黑实蝇的标本中提取腿端黑实蝇的基因组DNA。
6.根据权利要求4所述的种特异性引物对快速鉴定腿端黑实蝇的方法,其特征在于,S2中,所述被鉴定生物体的DNA具体为:来自卵生物形态的DNA、来自幼虫生物形态的DNA、来自蛹生物形态的DNA、来自生物残体的DNA;
其中,所述生物残体指头、胸、腹、翅或足;
此外,通过以下方法,提取被鉴定生物体的DNA:
选用整只腿端黑实蝇、或腿端黑实蝇的残体、或腿端黑实蝇的卵、幼虫或蛹作为样本;将所选用的样本置于2ml离心管中,加入液氮充分研磨;然后,将研磨后的样本采用OMEGA E.Z.N.A.TM Insect DNA Kit试剂盒法提取DNA,并将最终提取到的DNA保存于-20℃备用。
7.根据权利要求4所述的种特异性引物对快速鉴定腿端黑实蝇的方法,其特征在于,S3中,所述SS-PCR扩增的反应体系以25ul计,包括:
8.根据权利要求7所述的种特异性引物对快速鉴定腿端黑实蝇的方法,其特征在于,所述SS-PCR扩增的反应条件为:93~95℃预变性4~6min;93~95℃变性35~45s;退火温度50~60℃,25~35s;72℃延伸0.5~1.5min;20~30个循环,最后72℃延伸7~10min停止反应。
9.根据权利要求8所述的种特异性引物对快速鉴定腿端黑实蝇的方法,其特征在于,所述SS-PCR扩增的反应条件为:94℃预变性5min;94℃变性40s;退火温度55℃,30s;72℃延伸1min;30个循环,最后72℃延伸7min停止反应。
10.根据权利要求4所述的种特异性引物对快速鉴定腿端黑实蝇的方法,其特征在于,S4中,所述采用电泳检测SS-PCR扩增产物,判断所述SS-PCR扩增产物是否含有444bp的特征条带,具体为:
S4.1,提取SS-PCR扩增后的5ul SS-PCR产物;
S4.2,在含DNA染色剂的1.5%的琼脂糖凝胶多功能电泳仪上,对所述5ul SS-PCR产物120V电泳30min;
S4.3,利用凝胶成像分析仪检测电泳后是否扩增出444bp的特征条带。
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