[发明专利]一种结核分枝杆菌标准株H37Rv的DNA适配子及其制备方法在审
申请号: | 201510379009.2 | 申请日: | 2015-07-01 |
公开(公告)号: | CN104946655A | 公开(公告)日: | 2015-09-30 |
发明(设计)人: | 秦莲花;胡忠义;杨华;如斯坦木江·艾麦提 | 申请(专利权)人: | 上海市肺科医院 |
主分类号: | C12N15/115 | 分类号: | C12N15/115;C12N15/10;G01N33/569 |
代理公司: | 上海申新律师事务所 31272 | 代理人: | 竺路玲 |
地址: | 200433 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 结核 分枝杆菌 标准 sub 37 rv dna 配子 及其 制备 方法 | ||
1.一种结核分枝杆菌标准株H37Rv的DNA适配子,其特征在于:所述DNA适配子的核苷酸序列为:
5’-GGGAGCTCAGAATAAACGCTCAATATCCCTATTCCGCTCCATGTTGCGTACCCGTGCCTTCGACATGAGGCCCGGATC-3’。
2.如权利要求1所述的DNA适配子在细菌学检测中的应用。
3.根据权利要求2所述的DNA适配子在细菌学检测中的应用,其特征在于,在检测结核分枝杆菌中的应用。
4.一种结核分枝杆菌检测试剂盒,其特征在于,包含有如权利要求1所述的DNA适配子。
5.一种制备如权利要求1所述的DNA适配子的方法,其特征在于包括以下步骤:
步骤1,构建随机单链寡核苷酸文库:设计合成78碱基的随机单链DNA文库:5’-GGGAGCTCAGAATAAACGCTCAA-N35-TTCGACATGAGGCCCGGATC-3’,其中N代表碱基AGCT中的任意一个,文库容量为1014-1015,并进一步纯化单链ssDNA文库用于结核分枝杆菌标准株H37Rv适配子的SELEX技术筛选;
步骤2,利用SELEX技术筛选H37Rv适配子:用包被缓冲液将结核分枝杆菌标准株H37Rv包被于微孔板中,同时设空白反筛孔,非结核分枝杆菌和非分枝杆菌反筛孔;ssDNA文库和SELEX结合缓冲液混匀后先与空白反筛孔进行孵育;然后转移到H37Rv包被孔进行孵育,SELEX冲洗缓冲液洗涤,甩干后加入SELEX洗脱缓冲液洗脱与H37Rv结合的ssDNA,产物经酚氯仿抽提、乙醇沉淀纯化,PCR扩增后,进行10轮筛选,筛选后的饱和文库,经克隆测序,获得单个适配子。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:步骤2中使用的SELEX结合缓冲液成分为:20mmol/L Hepes,120mmol/L NaCl,5mmol/L KCl,1mmol/L CaCl2,1mmol/L MgCl2;SELEX结合缓冲液pH为7.35。
7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:步骤2中使用SELEX冲洗缓冲液成分为:20mmol/L Hepes,120mmol/L NaCl,5mmol/L KCl,1mmol/L CaCl2,1mmol/L MgCl2,0.05%Tween 20。
8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:步骤2中使用SELEX洗脱缓冲液成分为:20mmol/L Tris-HCl,4mol/L异硫氰酸胍,1mmol/L DTT;SELEX洗脱缓冲液pH为8.3。
9.一种三明治夹心ELISA检测方法,其特征在于:利用如权利要求1所述的结核分枝杆菌标准株H37Rv的DNA适配子进行检测。
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