[发明专利]基于LAMP实时荧光法的猪等孢球虫卵囊检测方法及其引物在审
申请号: | 201510344540.6 | 申请日: | 2015-06-19 |
公开(公告)号: | CN104862415A | 公开(公告)日: | 2015-08-26 |
发明(设计)人: | 王寿昆;黄翠琴;温福利;岳良平 | 申请(专利权)人: | 龙岩学院;福建农林大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/90 |
代理公司: | 福州君诚知识产权代理有限公司 35211 | 代理人: | 戴雨君 |
地址: | 364000 *** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 lamp 实时 荧光 虫卵 检测 方法 及其 引物 | ||
1.检测猪等孢球虫卵囊的引物,其特征在于:所述引物如下:
上游外引物F3:5'-ATAGGATCAGGACCTCGTG-3';
下游外引物B3:5'-GGCATTCCTCGTTGAAGAT-3';
上游内引物FIP(F1c-F2):
5'-CGTGCAGCCCAGAACATCTGTGTCTAACGCAAGGAAGT-3';
下游内引物BIP(B1c-B2):
5'-ACACTGATGCATCCAACGAGTTTCACGATGCATACTCACAAG-3';
上游环引物LoopF:5'-TCACAGACCTGTTATTGCCTC-3';
下游环引物LoopB:5'-TGGCCGATAGGTCTAGGTAAT-3'。
2.采用权利要求1所述的引物基于LAMP实时荧光法的猪等孢球虫卵囊检测方法,其特征在于:其包括以下步骤
1)猪等孢球虫卵囊的收集与纯化
采集新鲜的仔猪粪样,用饱和盐水漂浮法对卵囊进行收集,采用Sheather氏蔗糖溶液梯度离心法对收集的卵囊进行纯化,具体操作方法是:取含猪等孢球虫卵囊的粪便溶于9-10倍体积水中,依次经80目和120目筛过滤后,然后2000-2500rpm离心2-3min,弃上清,加入沉淀9-10倍体积的饱和盐水,3000-3500rpm离心2-3min,取上清液并加入上清液5-6倍体积的浓度2.5%的重铬酸钾溶液,即为收集的卵囊液;
取收集的卵囊液进行1:1Sheather氏蔗糖溶液梯度离心,4000-4500rpm离心15-20min,然后取卵囊层和1/3蔗糖溶液上清,加入其5-6倍水稀释后,进行1:2Sheather氏蔗糖溶液梯度离心,4000-4500rpm离心15-20min,收集上层卵囊液,即为纯化后的卵囊液;
其中,所述1:1Sheather氏蔗糖溶液是指卵囊液和Sheather氏蔗糖溶液的体积比为1:1;所述1:2Sheather氏蔗糖溶液是指卵囊液和Sheather氏蔗糖溶液的体积比为1:2;
2)猪等孢球虫卵囊DNA的提取
采用粪便基因组DNA快速提取试剂盒,按照试剂盒的操作说明,从上述纯化后的卵囊液中提取猪等孢球虫卵囊的DNA,置-20℃冰箱保存;
3)目的基因的LAMP扩增:
采用权利要求1所述的引物进行LAMP反应,通过实时荧光定量PCR仪对LAMP反应的过程进行实时荧光信号的采集并监测;
反应体系根据DNA扩增试剂盒配制,所述反应系具体如下:
反应液RM(2×)12.5μL;
Bst聚合酶1.0μL;
荧光染料Ⅰ0.5μL;
DNA模板1-100ng;
上下游内引物的终浓度0.4-1.6μM;
上下游外引物的终浓度0.1-0.2μM;
上下游环引物的终浓度0.1-0.8μM;
补充超纯水至反应总体系为25μL,其中,所述DNA模板是指步骤2)提取的猪等孢球虫卵囊的DNA模板。
3.根据权利要求2所述的基于LAMP实时荧光法的猪等孢球虫卵囊检测方法,其特征在于:步骤3)所述的反应条件是63℃反应1h,每隔60s用FAM通道检测一次荧光信号,以0.2℃/s的增量从63℃升温至95℃并采集荧光信号分析熔解曲线。
4.根据权利要求2所述的基于LAMP实时荧光法的猪等孢球虫卵囊检测方法,其特征在于:步骤2)的具体操作方法如下:具体操作方法如下:取纯化后的卵囊液200μL于液氮和37℃水浴锅中反复冻融5次,每次1min;然后加入10μL的蛋白酶K和50μL溶菌酶,涡漩混匀1min,37℃水浴15min,期间每隔2-3min剧烈震荡混匀;然后加入100μL的DNA提取液,涡漩混匀1min,65℃水浴10min,期间每隔2-3min剧烈震荡混匀;10000rpm离心10min,取上清至新的1.5mL离心管,加入约为上清的1/3体积蛋白沉淀液,混匀;冰浴8min,13000rpm离心10min,将上清置于处理后的纯化柱,4000rpm离心3min;将虑液置于新的离心管中,并与滤液0.6倍体积的异丙醇震荡混匀,13000rpm离心10min,倒扣离心管2min;70%乙醇洗涤沉淀,30μL洗脱缓冲液EB溶解沉淀,将提取的猪等孢球虫卵囊DNA置-20℃冰箱保存。
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