[发明专利]一种筛查十一种疾病的基因标志物组合、试剂盒以及疾病风险预测模型

权利要求书

1.一种利用外周血基因表达谱筛查十一种疾病的基因标志物组合，其特征在于由肺癌、胃癌、肝癌、鼻咽癌、前列腺癌、乳腺癌、宫颈癌、大肠癌、溃疡性结肠炎、克罗恩氏症和骨关节炎十一种疾病的特征性基因库组成：

肺癌特征性基因库：QKI、C16orf30、PUM2、MLL3、C1orf58；

胃癌特征性基因库：SLC6A6、KPNB1、FDFT1、HSPD1、MLL3、ATP5O；

肝癌特征性基因库：THRAP2、C14orf119、CYFIP2、CUGBP2、ZMYM6；

鼻咽癌特征性基因库：SOD1、USP7、TMEM183A/B、LIMS1、KMT2C、NUFIP2；

前列腺癌特征性基因库：BAZ2B、PSD4、TMEM204、LINC00152///LOC541471、PHACTR2；

乳腺癌特征性基因库：KBTBD2、TUBGCP3、ZBTB7A、ZNF182、LYPLA1、OGT；

宫颈癌特征性基因库：USP7、ROPN1L、ERGIC1、ZFP62；

大肠癌特征基因库：MYCBP2、CACYBP、APPL、CYFIP2、MTDH、REEP5；

溃疡性结肠炎特征性基因库：ANKRD13、ACADVL、MED28；DNAJB14、TMEM43；

克罗恩氏症特征性基因库：NFAT5、SIPA1L1、C6orf111、HIST1H1C、RBM7、GALNT7；

骨关节炎症特征性基因库：GOLGA7、PTEN、ZBTB7A、NKTR、VDAC1。

2.如权利要求1所述基因标志物组合的检测试剂在制备十一种疾病的诊断试剂中的应用，所述十一种疾病为肺癌、胃癌、肝癌、鼻咽癌、前列腺癌、乳腺癌、宫颈癌、大肠癌、溃疡性结肠炎、克罗恩氏症和骨关节炎。

3.一种利用外周血基因表达谱筛查疾病的疾病特征基因的筛选方法，其特征在于所述疾病特征基因如权利要求1所示，采用如下步骤：

(1)选择肺癌、胃癌、肝癌、鼻咽癌、前列腺癌、乳腺癌、宫颈癌、大肠癌、溃疡性结肠炎、克罗恩氏症和骨关节炎纳入筛选库，对每种疾病采集一定数量样本以及一定数量健康人群样本，使用人类全基因组表达谱芯片检测所有样本的外周血总RNA样品；

(2)对每个样本的基因表达谱芯片检测结果进行归一化处理；分析样本的基因表达水平，剔除表达谱芯片检测结果中不稳定的基因的信号，选择在所有样本中均有稳定表达的基因进行疾病相关性分析；

(3)依据基因表达水平与疾病的相关性程度排序，选择与疾病相关性高以及与疾病相关性低的基因进行两两配对，组成系列侯选基因对；

(4)将侯选基因对随机组合成若干个基因对为一组的基因组合，利用自助抽样方法和逻辑回归分析方法评估不同基因组合对疾病的甄别能力，建立逻辑回归分析模型，计算每一基因组合对目标疾病诊断的受试者操作曲线AUC值，挑选AUC值高的基因组合作为疾病侯选特征基因组合进行后续分析；

(5)将上述基因组合按AUC值高低进行排序，选择对目标疾病、健康人群、以及筛选库中除目标疾病以外的其它疾病具有最佳区分能力的基因组合作为疾病特征基因，用MedCalc软件计算阳性样本和阴性样本区分的最佳临界值作为区分阳性和阴性检测结果的标准和逻辑回归模型的一项参数；

所述逻辑回归分析模型为：其中，p为样本预测为疾病的风险概率；n为疾病的特征基因数；c₀和c_g为逻辑回归参数；E_g为特征基因的表达水平。