[发明专利]用于检测环境污染物DEHP的基因芯片及其制备方法和应用有效
| 申请号: | 201510284160.8 | 申请日: | 2015-05-28 |
| 公开(公告)号: | CN105040109B | 公开(公告)日: | 2017-05-03 |
| 发明(设计)人: | 李成华;陈晓聪;金春华;李晔;张卫卫;韩庆喜 | 申请(专利权)人: | 宁波大学 |
| 主分类号: | C40B40/06 | 分类号: | C40B40/06;C40B50/06;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 宁波奥圣专利代理事务所(普通合伙)33226 | 代理人: | 何仲 |
| 地址: | 315211 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 检测 环境 污染物 dehp 基因芯片 及其 制备 方法 应用 | ||
1.一种用于检测环境污染物DEHP的基因芯片,包括点制在玻片上的探针,其特征在于:所述的探针包括探针1、探针2和探针3,所述的探针1核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述的探针2核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述的探针3核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
2.根据权利要求1所述的用于检测环境污染物DEHP的基因芯片,其特征在于:用于扩增探针1的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;用于扩增探针2的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示;用于扩增探针3的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示。
3.一种根据权利要求1所述的用于检测环境污染物DEHP的基因芯片的制备方法,其特征在于包括以下步骤:
a、总RNA的提取:取蛤仔体腔液制备RNA提取液;
b、cDNA合成:取上述RNA提取液合成cDNA,具体合成方法依cDNA合成试剂盒说明书进行;
c、PCR扩增:50μL扩增体系:10×Buffer 10.0μL,终浓度200μM的dNTP mix 4.0μL,5U/μL的TqDNA聚合酶0.4μL,10μM的正反向引物各1μL,10~100ng的cDNA溶液1μL,ddH2O补充至50.0μL;扩增反应条件:95℃5min;94℃45s,55~58℃45s,72℃45s,35个循环;后延伸72℃10min;d、探针制备:将50μL异丙醇加入到PCR扩增产物中混匀,-20℃放置30min,4℃,12000g离心5min,取DNA沉淀,然后加入100μL体积浓度为75%的乙醇水溶液洗一次,12000g离心5min,小心去掉上清,干燥,加10μL无菌水溶解,得到探针溶液;
e、芯片制备:取5μL探针溶液作为探针与5μL点样液混合,有序的点印在预制好的玻片上,设计阳性对照、阴性对照并以点样液为空白对照,即得到用于检测环境污染物DEHP的基因芯片。
4.根据权利要求3所述的用于检测环境污染物DEHP的基因芯片的制备方法, 其特征在于:所述的探针溶液中包括包括探针1、探针2和探针3,所述的探针1核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述的探针2核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述的探针3核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
5.根据权利要求3或4所述的用于检测环境污染物DEHP的基因芯片的制备方法,其特征在于:所述的引物溶液中包括
用于扩增探针1的正向引物,其核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示:
5'-GGGACATATCCAATGGTGAC-3',
用于扩增探针1的反向引物,其核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示
5'-GCCCTCTTGCGTTCTAGTTT-3';
用于扩增探针2的正向引物,其核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示:
5'-TGCCCGTGCTTACTATTGAC-3',
用于扩增探针2的反向引物,其核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示:
5'-CCTTTCTTCCTCGTTATCCT-3';
用于扩增探针3的正向引物,其核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示:
5'-TGAGCGTTGAAGAAGGTTTG-3',
用于扩增探针3的反向引物,其核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示:
5'-CGGTTTACCGCAGTCTATCC-3'。
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