[发明专利]一种用于快速鉴定4型登革热病毒的RT-LAMP试剂盒在审
申请号: | 201510282511.1 | 申请日: | 2015-05-28 |
公开(公告)号: | CN104946792A | 公开(公告)日: | 2015-09-30 |
发明(设计)人: | 黄曦;胡胜锋 | 申请(专利权)人: | 中山大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 胡辉;郑莹 |
地址: | 510080 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 快速 鉴定 登革热 病毒 rt lamp 试剂盒 | ||
技术领域
本发明涉及病原微生物的检测与鉴定,具体涉及一种用环介导等温基因扩增技术(LAMP技术)快速鉴定4型登革热病毒的方法。
背景技术
登革热病毒(Dengue virus,DENV)是一种黄病毒类RNA病毒,主要包括1~4型病毒(DENV 1~4)。登革热病毒主要通过埃及伊蚊(Aedes aegypti)和白纹伊蚊(Aedes albopictus)传播,登革热病毒的感染可以引起登革热(dengue fever,DF),严重的还可导致登革出血热(Dengue hemorrhagic fever,DHF)或登革休克综合征(Dengue shocksyndrome,DSS)等。DENV广泛流行于全球的热带和亚热带地区,我国主要分布于广东、海南、广西、福建、台湾等省(自治区)。ENV-4型1979年从海南岛儋县北部白马镇开始沿西海岸向南北蔓延,波及堪江、佛山、广州、汕头、韶关等地区以及广西的北海、合浦,连续流行3年。
目前登革热病毒的鉴定方法主要为PCR,ELISA、免疫胶体金等方法。登革热检测常用的ELISA、免疫胶体金方法耗时长,通常需要5~7 d血清中才能达到抗体能够检测水平,同时登革热抗体与其他黄病毒存在交叉反应,出现假阳性率较高,故血清学检测作为登革热病毒检测局限性较大;DENV的分离可以很好的鉴定登革热病毒,但同样耗时长,敏感度又很低,也不可以作为早期检测登革热病毒的手段。近10 多年发展起来的DENV核酸检测技术,为登革热的早期诊断提供了可能,但PCR以及RT-PCR都需要昂贵的PCR仪作为基础,也在一定程度上限制了PCR方法在鉴定登革热病毒上的发展。
以上各种方法虽然可能在临床上提供较好的价值,但因耗时长、繁琐的操作过程、灵敏度低、需要昂贵的仪器设备等不同的原因未能在临床上大规模推广使用。环介导等温基因扩增技术(Loop-Mediated Isothermal Amplification,以下简称LAMP法)是日本荣研化学株式会社于2000年前后开发出的基因扩增技术,其具有快速简便、操作准确、容易普及、安全可靠的优点,目前尚未有将LAMP法应用于快速鉴定4型登革热病毒。
发明内容
本发明的目的在于提供一种用于快速鉴定3型登革热病毒的RT-LAMP试剂盒、以及一种用环介导等温基因扩增技术(LAMP技术)快速鉴定4型登革热病毒的方法。本鉴定方法方便快捷、价格低廉,适于推广应用。
本发明所采取的技术方案是:
一种用于快速鉴定4型登革热病毒的RT-LAMP试剂盒,包括以下组分:(1)用于快速鉴定4型登革热病毒的RT-LAMP特异性引物组;(2)逆转录酶;(3)DNA聚合酶;(4)RT-LAMP反应液;(5)显色剂;(6)阳性对照和阴性对照;其中,所述用于快速鉴定4型登革热病毒的RT-LAMP特异性引物组包括:
内引物1:5’- CGTTATTGGCGGAGCTACAGGGAGGCTATTGAAGTCAGGC-3’(SEQ ID No.1);
内引物2:5’
-GTGGACTAGCGGTTAGAGGAGAGAGACTACAGCTTCATCTCAC-3’ (SEQ ID No.2);
外引物1:5’- GCTCCTTTCGAGAGTGAAG -3’(SEQ ID No.3);
外引物2:5’-GGTCTCCTCTAACCTCTAGTC-3’(SEQ ID No.4);
环引物1:5’-CAGCACGGTTTGCTCAAG-3’(SEQ ID No.5);
环引物2:5’- CCTTACAAATCGCAGCAACAA-3’(SEQ ID No.6)。
所述引物组中,内引物、外引物、环引物的摩尔比为6~8:1:3~4。
所述逆转录酶为AMV逆转录酶;所述DNA聚合酶为Bst DNA聚合酶。
所述RT-LAMP反应液含有:10mM dNTP、10×ThermoPol反应缓冲液、150mM MgSO4溶液、5mM 甜菜碱,四者的体积比为6~8:4~5:2~3:8~10。
所述显示剂为SYBR GREENⅠ。
所述阳性对照为含有4型登革热病毒NS1基因片段(SEQ ID NO.7)的质粒,阴性对照为DEPC水。
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