[发明专利]基于芯片进行规模化快速制备单根寡核苷酸的方法有效
申请号: | 201510252872.1 | 申请日: | 2015-05-18 |
公开(公告)号: | CN104892711B | 公开(公告)日: | 2017-11-07 |
发明(设计)人: | 洪泂;高晓连;李璐璐 | 申请(专利权)人: | 中国科学技术大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12N15/11;C40B40/06 |
代理公司: | 中科专利商标代理有限责任公司11021 | 代理人: | 王旭 |
地址: | 230026 安*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 芯片 进行 规模化 快速 制备 寡核苷酸 方法 | ||
1.一种高通量合成和纯化寡核苷酸的方法,所述方法包括以下步骤:
1)设计寡核苷酸序列,在寡核苷酸两端加上通用引物,以将合成的全部寡核苷酸分成若干亚库,不同亚库具有不同的通用引物,同一亚库具有相同通用引物,所述通用引物上含有IIS型内切酶的酶切位点;
2)进行基于微芯片的DNA原位合成,并洗脱合成产物;
3)利用所述通用引物对所述合成产物进行PCR扩增;
4)分离扩增产物;
其中
每个亚库含有5-11根长度不同的寡核苷酸;并且
每个亚库中相邻长度的寡核苷酸相差至少4个碱基的长度,
所述亚库以要合成的寡核苷酸片段大小来分配,
在寡核苷酸和一侧的通用引物之间还具有接头序列,
所述接头序列含有IIS型内切酶的酶切位点。
2.根据权利要求1所述的方法,步骤4)中的分离使用聚丙烯酰胺凝胶电泳进行。
3.根据权利要求1所述的方法,所述方法在步骤4)后还包括用IIS型内切酶酶切和/或用相应通用引物选择性PCR扩增分离后的独立寡核苷酸的步骤。
4.根据权利要求1所述的方法,所述IIS型内切酶是内切酶Sch I,Bbs I或Bsa I。
5.根据权利要求1所述的方法,所述微芯片是4k芯片。
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