[发明专利]用于以RT‑LAMP法快速检测香蕉病毒的引物及方法有效
申请号: | 201510250389.X | 申请日: | 2015-05-15 |
公开(公告)号: | CN104805221B | 公开(公告)日: | 2017-08-25 |
发明(设计)人: | 张景欣;林壁润;沈会芳;蒲小明;孙大元 | 申请(专利权)人: | 广东省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司44245 | 代理人: | 裘晖 |
地址: | 510640 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 rt lamp 快速 检测 香蕉 病毒 引物 方法 | ||
1.用于以RT-LAMP法快速检测香蕉重要病毒的引物,其特征在于:包括BBTV引物组、BSV引物组和CMV引物组,其中,BBTV引物组包括外引物对BBTV-F3和BBTV-B3,内引物对BBTV-FIP和BBTV-BIP,以及环引物对BBTV-LF和BBTV-LB;BSV引物组包括外引物对BSV-F3和BSV-B3,内引物对BSV-FIP和BSV-BIP,以及环引物对BSV-LF和BSV-LB;CMV引物组包括外引物对CMV-F3和CMV-B3,内引物对CMV-FIP和CMV-BIP,以及环引物对CMV-LF和CMV-LB,序列如下所示:
BBTV-F3:5'-CTA CTG ATA AAA CAT TAC CCA GAT-3';
BBTV-B3:5'-TCC CCA CTA CAT ACC AGT T-3';
BBTV-FIP:5'-CTC TTG ATC ATA GCC CAA TGA AGT ATG GAA AAT GTT TAT GCT TCT TGT-3';
BBTV-BIP:5'-TCT TGG GAA ATC AAC CAG CCG TAACCAGAT GGC TAT GTT CAG-3';
BBTV-LF:5'-CGG GCT TCACCT TGC AC-3';
BBTV-LB:5'-TCT GGAAGC CCC AGG TTT AT-3';
BSV-F3:5'-ATG CTAGGA GCT ACATTC C-3';
BSV-B3:5'-TCC ACT TAC ATA CCC CTC C-3';
BSV-FIP:5'-CCA GTC CTG AGT ATT CAT TCT TCT TGA AAC TGG GAA AAA TCC TTG G-3';
BSV-BIP:5'-GAA GTT GTA GCT AAT CTG CCA GAA TCC ATA CAG CCA TCC GTT-3';
BSV-LF:5'-GGA CTC GTT TTG GCA TAC AGT G-3';
BSV-LB:5'-CTT GAG TTA CCC CCC GAA AAA GC-3';
CMV-F3:5'-CGT AAA GTT CCT GCC TCC TC-3';
CMV-B3:5'-GGT GCT CGA TGT CAA CAT GA-3';
CMVI-FIP:5'-GGC TTG AAC TCC AGA TGC AGC AGC CGC CAT CTC TGC TAT G-3';
CMV-BIP:5'-TTC GGT GAT GCG CGC TGA TAG TCT CGA GCG CAT CGT CT-3';
CMV-LF:5'-AGT ACC GGT GAG GCT CCG TC-3';
CMV-LB:5'-GGT GAC ATG AGA AAG TAC GCC GT-3'。
2.一种利用权利要求1所述的引物以RT-LAMP法快速检测香蕉重要病毒的检测方法,其特征在于包括以下步骤:
(1)对样本进行处理,抽提样本RNA;
(2)直接以样本RNA为模板,利用权利要求1所述的引物以实时荧光RT-LAMP法进行检测。
3.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于:所述的样本处理指抽提香蕉叶片RNA作为样本RNA。
4.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于:所述样本RNA在检测前进行DNase处理。
5.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于:所述DNase处理反应体系及反应程序如下:RNA 2μL,10×Reaction Buffer 1μL,RQ1 RNase-Free DNase 1U/μg RNA,加6μL Nuclease-free water至终体积10μL,37℃反应30min;加入1μL RQ1DNase Stop Solution终止反应,65℃反应10min。
6.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于:所述RNA的抽提方法用植物RNA提取试剂盒进行抽提。
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