[发明专利]用于辅助评价待测者肺癌遗传风险性的试剂盒有效
| 申请号: | 201510224185.9 | 申请日: | 2015-05-04 |
| 公开(公告)号: | CN104862389A | 公开(公告)日: | 2015-08-26 |
| 发明(设计)人: | 由晓斌;兰兆吉 | 申请(专利权)人: | 广州拓普基因科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 广州三环专利代理有限公司 44202 | 代理人: | 戴建波;朱本利 |
| 地址: | 510635 广东省广州*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 辅助 评价 待测者 肺癌 遗传 风险 试剂盒 | ||
1.一种用于辅助评价待测者肺癌遗传风险性的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:
针对单核苷酸多态性位点rs2285947的引物,以及
针对单核苷酸多态性位点rs2494938的引物。
2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒进一步包括针对单核苷酸多态性位点rs4488809的引物。
3.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述针对单核苷酸多态性位点rs2285947的引物包括:
rs2285947上游引物:AGTATGATGAGTTTGGAGCA;
rs2285947下游引物:GGAAATAAGCCAAACTGAGA。
4.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述针对单核苷酸多态性位点rs2494938的引物包括:
rs2494938上游引物:ACTAAGCCTCAGTCAAGGTTTG;
rs2494938下游引物:TAGCGAGGCATTTGGAACAG。
5.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述针对单核苷酸多态性位点rs4488809的引物包括:
rs4488809上游引物:GGGAAGGTAGAATATATGAGT;
rs4488809下游引物:AAGCCCTCTCAATATCTG。
6.权利要求1-5之一所述试剂盒的检测结果的评估方法,其包括如下步骤:
A、将单核苷酸多态性位点rs2285947、rs2494938、rs4488809的不同基因型进行风险度赋值;
B、提取受检者的DNA;
C、使用以下引物对进行PCR扩增反应:
(1)rs2285947上游引物:AGTATGATGAGTTTGGAGCA;
rs2285947下游引物:GGAAATAAGCCAAACTGAGA;
(2)rs2494938上游引物:ACTAAGCCTCAGTCAAGGTTTG;
rs2494938下游引物:TAGCGAGGCATTTGGAACAG;
(3)rs4488809上游引物:GGGAAGGTAGAATATATGAGT;
rs4488809下游引物:AAGCCCTCTCAATATCTG;
D、PCR扩增产物纯化;
E、DNA测序,确定单核苷酸多态性位点rs2285947、rs2494938、rs4488809的基因型;
F、根据步骤A,确定步骤E所测得的单核苷酸多态性位点rs2285947、rs2494938、rs4488809的基因型的风险值Risk(rs2285947)、Risk(rs2494938)、Risk(rs4488809);
G、根据步骤F得到的三个风险值Risk(rs2285947)、Risk(rs2494938)、Risk(rs4488809)判断受检者的风险级别。
7.如权利要求6所述的评估方法,其特征在于,所述步骤G具体包括如下步骤:
G1、计算三个单核苷酸多态性位点的总风险值R,计算公式为
总风险值R=Risk(rs2285947)×Risk(rs2494938)×Risk(rs4488809);
G2、根据如下标准判断风险级别:
总风险值R<0.91 风险较低
0.91≤总风险值R≤1.08 风险一般
总风险值R>1.08 风险较高。
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