[发明专利]用于RET融合基因检测的引物、探针及检测试剂盒

权利要求书

1.一种用于RET融合基因检测的引物、探针，其特征在于：包括RET融合突变特异性反转录引物及RET基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列；所述的RET融合突变特异性反转录引物具体为：

RET反转录1：    TGAAGGAGAAGAGGACAGCG            SEQ ID NO：01

RET反转录2：    CACCGGAAGAGGAGTAGCTGAC          SEQ ID NO：02

RET反转录3：    CCAAATTCGCCTTCTCCTAGAG          SEQ ID NO：03

Actin反转录4：   CAGGAGGAGCAATGATCTTG            SEQ ID NO：04；

所述的RET基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列包括KIF5B和RET-12基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列、CCD1、CCD2、ERC和RET-12基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列、GOLGA7F、NCOA8F、HOOK11F和RET-12基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列、PCM29F、PRKAR7F、KTN29F和RET-12基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列、TRIM24、TRIM33和RET-12基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列、KIF5B-24和RET-11基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列及KIF5B-15和RET-11基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列；所述的KIF5B和RET-12基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列具体为：

KIF15F        GAAATAGGAATTGCTGTGGGAAAT             SEQ ID NO：05

KIF16F        TAGCAGCATGTCAGCTTCGTAT                SEQ ID NO：06

KIF22F        CTCTTTGTTCAGGACCTGGCTAC              SEQ ID NO：07

KIF23F        AATCTTGAACAGCTCACTAAAGTGC            SEQ ID NO：08

RET12R        CCAAATTCGCCTTCTCCTAGAG               SEQ ID NO：09

Taqman Ret12  FAM-5- ATCCAAAGTGGGAATTCC-3-BHQ-MGB  SEQ ID NO：10；

所述的CCD1、CCD2、ERC和RET-12基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列具体为：

CCDC1F      GCACTGCAGGAGGAGAACC                   SEQ ID NO：11

CCDC2F      TTCCTCACTAATGAGCTCTCCAG               SEQ ID NO：12

ERC11F      TTGGAGCAGAAGAAGGAGGAG                 SEQ ID NO：13

RET12R      CCAAATTCGCCTTCTCCTAGAG                 SEQ ID NO：14

Taqman Ret12 FAM-5- ATCCAAAGTGGGAATTCC-3-BHQ-MGB   SEQ ID NO：15；

所述的GOLGA7F、NCOA8F、HOOK11F和RET-12基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列具体为：

GOLGA7F       GAAGCTGATGGGCCAGATACAT              SEQ ID NO：16

NCOA8F        CAGGACTGGCTTACCCAAAAG               SEQ ID NO：17

HOOK11F       AGTTAAGAAAGGCCAACGCAG               SEQ ID NO：18

RET12R        CCAAATTCGCCTTCTCCTAGAG               SEQ ID NO：19

Taqman Ret12  FAM-5- ATCCAAAGTGGGAATTCC-3-BHQ-MGB  SEQ ID NO：20；

所述的PCM29F、PRKAR7F、KTN29F和RET-12基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列具体为：

PCM29F        GACCGGCAAATTAAAGCAATTAT             SEQ ID NO：21

PRKAR7F       AATGTGAAATTGTGGGGCATC               SEQ ID NO：22

KTN29F        GCCATGCTAAAAGAGAGGGAG               SEQ ID NO：23

RET12R        CCAAATTCGCCTTCTCCTAGAG              SEQ ID NO：24

Taqman Ret12  FAM-5-ATCCAAAGTGGGAATTCC-3-BHQ-MGB  SEQ ID NO：25；

所述的TRIM24、TRIM33和RET-12基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列具体为：

TRIM24-9F     GCACCTGTGGGTTTACCAAAC               SEQ ID NO：26

TRIM33-16F    GTAAGAAGGGGAAAACTGCGC               SEQ ID NO：27

RET12R        CCAAATTCGCCTTCTCCTAGAG              SEQ ID NO：28

Taqman Ret12  FAM-5-ATCCAAAGTGGGAATTCC-3-BHQ-MGB  SEQ ID NO：29；

所述的KIF5B-24和RET-11基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列具体为：

KIF24F          TCGCATAAAGGAAGCAGTCAG                SEQ ID NO：10

K24R11R        TGAAGGAGAAGAGGACAGCG                SEQ ID NO：10

TaqmanK24R11  FAM-5-AAGAGGGCATTCTGCAC-3-BHQ-MGB   SEQ ID NO：30；

所述的KIF5B-15和RET-11基因融合突变检测特异性引物和探针核苷酸序列具体为：

KIF15F              GAAATAGGAATTGCTGTGGGAAAT      SEQ ID NO：31

K15R11R            CACCGGAAGAGGAGTAGCTGAC        SEQ ID NO：32

TaqmanK15R11 FAM-5-ATCTCCTCAGCTGAGATGAC-3-BHQ-MGB SEQ ID NO：33。