[发明专利]引物组、试剂盒及其在HPV全基因组检测中的用途

权利要求书

1.一组引物，其特征在于，包含选自SEQ ID NO：1-28的14对引物中的至少2对，所述14对引物的序列分别为SEQ ID NO：1和2、SEQ ID NO：3和4、SEQ ID NO：5和6、SEQ ID NO：7和8、SEQ ID NO：9和10、SEQ ID NO：11和12、SEQ ID NO：13和14、SEQ ID NO：15和16、SEQ ID NO：17和18、SEQ ID NO：19和20、SEQ ID NO：21和22、SEQ ID NO：23和24、SEQ ID NO：25和26以及SEQ ID NO：27和28；

任选的，包含选自SEQ ID NO：1-28的14对引物中的至少4对引物；

任选的，包含选自SEQ ID NO：1-28的14对引物中的至少6对引物；

任选的，包含选自SEQ ID NO：1-28的14对引物中的至少8对引物；

任选的，包含选自SEQ ID NO：1-28的14对引物中的至少10对引物；

任选的，包含选自SEQ ID NO：1-28的14对引物中的至少12对引物；

任选的，包含SEQ ID NO：1-28的14对引物。

2.权利要求1的一组引物，其特征在于，还包括序列如SEQ ID NO：29和30所示的一对引物。

3.权利要求1或2的一组引物在HPV基因组的扩增和/或HPV的检测中的用途。

4.一种试剂盒，其特征在于，包含权利要求1或2的一组引物。

5.权利要求4的试剂盒在HPV基因组扩增、HPV分型和/或HPV检测中的用途。

6.一种获得HPV全基因组序列的方法，其特征在于，包括以下步骤：

从待测样品中获得核酸；

利用权利要求1或2的一组引物扩增所述核酸，获得扩增产物；

对所述扩增产物进行序列测定，获得测序数据，所述测序数据包括多个读段；

基于所述测序数据，获得HPV全基因组序列。

7.权利要求6的方法，其特征在于，在获得扩增产物之后，包括：

电泳检测所述扩增产物，依据所得的电泳检测结果进行HPV分型。

8.权利要求6的方法，其特征在于，所述基于测序数据获得HPV全基因组序列，包括：

将所述测序数据中的读段与HPV参考序列进行比对，获得比对结果，

依据所述比对结果，组装出所述HPV全基因组序列。

9.权利要求8的方法，其特征在于，所述HPV参考序列包括HPV16参考序列、HPV18参考序列、HPV31参考序列、HPV33参考序列、HPV35参考序列、HPV39参考序列、HPV45参考序列、HPV51参考序列、HPV52参考序列、HPV56参考序列、HPV58参考序列、HPV59参考序列、HPV66参考序列和HPV68参考序列。

10.权利要求8的方法，其特征在于，所述HPV全基因组序列带有突变位点信息。