[发明专利]用于鉴定11个北京地方枣品种的引物及其应用有效
申请号: | 201510140984.8 | 申请日: | 2015-03-27 |
公开(公告)号: | CN104726598B | 公开(公告)日: | 2017-03-01 |
发明(设计)人: | 张铁强;胡灿丽;李子龙;雷慧;王志忠;马萱 | 申请(专利权)人: | 北京农学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司11245 | 代理人: | 关畅,白艳 |
地址: | 102206 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 鉴定 11 北京 地方 品种 引物 及其 应用 | ||
技术领域
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及用于鉴定11个北京地方枣品种的引物及其应用。
背景技术
枣(Ziziphus jujuba Mill.),鼠李科(Rhamnaceae),枣属(Ziziphus Mill.)。枣树原产我国,是果树栽培历史最久的果树之一,为古代五果之一,也是我国当今第一大干果。枣果实不仅营养丰富、味道甘美,同时又为补中益气、养血安神、缓和药性的常用中药,是集营养与医疗保健于一体的优质滋补品。
目前发现和记载的枣品种和优良类型达800多种,北京原产及引种栽培的一些枣品种或类型命名和种植比较混乱,所以亟需种质和品种鉴定的方法。
随着PCR技术的日益完善,许多基于PCR的分子标记大量涌现,其中,用于种质资源鉴定及植物育种的主要分子标记有限制性片段长度多态性(RFLP)、随机扩增多态性DNA(RAPD)、简单重复序列DNA(SSR)、扩增片段长度多态性(AFLP)以及染色体原位杂交等。
发明内容
本发明的目的是提供用于鉴定11个北京地方枣品种的引物及其应用。
本发明提供了如下1)-4)中任一所述物质在鉴定或辅助鉴定待测枣为北京地方枣品种中的应用:
1)引物对,所述引物对由序列表中序列1所示的引物1和序列表中序列2所示的引物2组成;
2)成套引物,所述成套引物由所述引物对和荧光引物,所述荧光引物的核苷酸序列为序列表中序列3;
3)含有所述引物对或所述成套引物的PCR试剂;
4)含有所述引物对或所述成套引物的试剂盒。
上述物质在区分或辅助区分北京地方枣品种中的应用也是本发明保护的范围。
上述应用中,所述荧光引物5’末端标记荧光基团;
所述北京地方枣品种为11个北京地方枣,所述11个北京地方枣具体为北安河脆枣、红螺脆枣、长辛店白枣、瓶儿枣、鸡心脆枣、缨络枣、郎家园枣、西峰山大家枣、京枣39、莲蓬籽枣和老虎眼枣。
本发明的另一个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定待测枣品种的方法。
本发明提供的方法,包括如下步骤:
1)用上述引物对对待测枣的基因组DNA进行PCR扩增,得到待测枣PCR扩增产物;
2)用上述荧光引物对所述待测枣PCR扩增产物进行荧光标记扩增,得到待测枣带荧光扩增产物;
3)将所述待测枣带荧光扩增产物进行毛细管电泳检测,
若所述待测枣带荧光扩增产物的大小为298.41bp和304.3bp,则所述待测枣为或候选为北安河脆枣;
若所述待测枣带荧光扩增产物的大小为303.28bp和307.49bp,则所述待测枣为或候选为红螺脆枣;
若所述待测枣带荧光扩增产物的大小为298.25bp和302.14bp,则所述待测枣为或候选为长辛店白枣;
若所述待测枣带荧光扩增产物的大小为298.33bp,则所述待测枣为或候选为瓶儿枣;
若所述待测枣带荧光扩增产物的大小为302.15bp和304.31bp,则所述待测枣为或候选为鸡心脆枣;
若所述待测枣带荧光扩增产物的大小为349.34bp,则所述待测枣为或候选为缨络枣;
若所述待测枣带荧光扩增产物的大小为298.32bp,则所述待测枣为或候选为郎家园枣;
若所述待测枣带荧光扩增产物的大小为301.8bp和303.85bp,则所述待测枣为或候选为西峰山大家枣;
若所述待测枣带荧光扩增产物的大小为302.29bp和304.36bp,则所述待测枣为或候选为京枣39;
若所述待测枣带荧光扩增产物的大小为304.34bp,则所述待测枣为或候选为莲蓬籽枣;
若所述待测枣带荧光扩增产物的大小为298.58bp,则所述待测枣为或候选为老虎眼枣;
若所述待测枣带荧光扩增产物的大小不满足上述任一种大小,则所述待测枣不为或候选不为11个北京地方枣品种中任一个,所述11个北京地方枣为北安河脆枣、红螺脆枣、长辛店白枣、瓶儿枣、鸡心脆枣、缨络枣、郎家园枣、西峰山大家枣、京枣39、莲蓬籽枣和老虎眼枣。
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