[发明专利]土壤中植物病原菌含量的检测方法有效

专利信息
申请号: 201510122856.0 申请日: 2015-03-19
公开(公告)号: CN104694658B 公开(公告)日: 2017-07-14
发明(设计)人: 张力群;郭松;张俊威;陈伟 申请(专利权)人: 中国农业大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/06;C12N15/10;C12R1/645
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司11245 代理人: 关畅,任凤华
地址: 100193 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 土壤 植物 病原菌 含量 检测 方法
【权利要求书】:

1.土壤中植物病原菌含量的检测方法,包括如下S1)和S2):

S1)、用提取土壤微生物DNA的方法提取待测土壤微生物DNA,得到待测土壤微生物DNA;

S2)、以所述待测土壤微生物DNA为模板,用鉴定植物病原菌的成套试剂进行荧光定量PCR,通过PCR产物的荧光强度确定所述待测土壤中所述植物病原菌的含量;所述鉴定植物病原菌的成套试剂由鉴定所述植物病原菌的PCR引物对和探针组成;所述PCR引物对由序列表中SEQ ID No.1所示的单链DNA和SEQ ID No.2所示的单链DNA组成;所述探针的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.3所示;

S1)所述提取土壤微生物DNA的方法包括如下S21)和S22)的步骤:

S21)向所述土壤中加入提取缓冲液得到细胞悬液;

S22)向所述细胞悬液中加入SDS得到细胞裂解液,所述细胞裂解液中的SDS的质量百分比浓度为4%,裂解细胞,得到裂解液;除去所述裂解液中的杂质得到所述待测土壤微生物DNA;

所述提取缓冲液由溶剂和溶质组成;所述溶剂为磷酸缓冲液,所述溶质及其浓度为1M Tris-HCl、0.1M EDTA、1.5M NaCl、质量百分比浓度为2%的CTAB、质量百分比浓度为2%PVP;所述磷酸缓冲液由溶质和溶剂组成的缓冲液,所述溶剂为水,所述溶质为NaH2PO4和Na2HPO4,所述NaH2PO4在所述磷酸缓冲液中的浓度为6.8mM,所述Na2HPO4在所述磷酸缓冲液中的浓度为93.2mM,所述磷酸缓冲液的pH为8.0;

S21)包括下述S21a)和S21b):

S21a)向所述土壤中加入所述提取缓冲液得到土壤悬液;所述土壤的量为100g;

S21b)破碎所述土壤悬液中的土壤颗粒得到所述细胞悬液;

S21a)中所述土壤悬液中土壤颗粒的直径在50微米以下;

S21b)中所述破碎所述土壤悬液中的土壤颗粒为德国Retsch生产的PlanetaryBall Mill PM400仪器处理所述土壤悬液;所述处理的时间为5-20分钟;

所述植物病原菌为十字花科根肿病菌。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述提取土壤微生物DNA的方法中,所述除去所述裂解液中的杂质得到所述待测土壤微生物DNA包括S22a)和S22b):

S22a)向所述裂解液中加入PEG溶液除去所述裂解液中的杂质得到DNA溶液;

S22b)用PVPP除去所述DNA溶液中的杂质得到所述待测土壤微生物DNA;

所述PEG溶液由水、NaCl和PEG组成;所述PEG溶液中所述NaCl的浓度为1.6M,所述PEG的质量百分浓度为30%-50%。

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