[发明专利]一种基于DNA自组装和G四聚体的分子检测方法及检测试剂盒有效

专利信息
申请号: 201510102241.1 申请日: 2015-03-09
公开(公告)号: CN104726572B 公开(公告)日: 2017-05-31
发明(设计)人: 陈俊华;周顺桂;温俊林 申请(专利权)人: 广东省生态环境与土壤研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司44205 代理人: 郑莹
地址: 510650 *** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 dna 组装 四聚体 分子 检测 方法 试剂盒
【说明书】:

技术领域

发明涉及一种基于核酶的分子检测方法,特别涉及基于DNA自组装和G四聚体的分子检测方法及基于该方法的检测试剂盒。

背景技术

环境中存在多种对人体有害的分子,快速、低成本地检测出这些有害小分子具有非常实际的意义。

双酚A(Bisphenol A,BPA),化学名为2,2-二(4-羟基苯基)丙烷,主要用于合成环氧树脂,聚碳酸酯等多种高分子材料,被广泛用于生产各种塑料制品。双酚A主要通过食品包装材料、饮水杯、供水管、奶瓶以及塑料薄膜等渗入食品而进入体内,并能在生物体内富集,并且不易被降解。即使极低的浓度的双酚A也会对内分泌系统、免疫系统、生殖系统产生一系列的不良影响。传统的双酚A检测技术主要有高效液相色谱法等一些仪器分析方法,这些技术需要繁琐的样品前处理和昂贵的仪器,检测成本高、费时耗力,难以用于大批量样本的实地现场快速检测。

另外,也有以抗体来检测双酚A的技术,但是抗体的制备过程麻烦,保存条件苛刻,而且需要多次洗涤与分离过程,因而限制了它们的广泛应用。

G四聚体序列是由富含G碱基的一段单链DNA组成,在缓冲体系和hemin(氯高铁血红素)存在的情况下,可折叠成G四聚体二级结构。G四聚体具有类似HRP(辣根过氧化物酶)的催化活性,可催化氧化TMB(四甲基联苯胺)产生蓝色底物,使反应溶液肉眼可见。以G四聚体来检测双酚A具有操作简单,方便现场快速分析等优点。但是基于G四聚体的比色法检测灵敏度低,需要进一步提高灵敏度。传统的信号放大技术主要是PCR以及一系列依赖工具酶的信号扩增技术,但是酶的使用不仅增加了成本和操作步骤,而且酶的存储也比较麻烦,因此需要研发一种无需工具酶信号扩增技术来提高检测灵敏度。

核酸适体(aptamer,源于拉丁语)指的是经体外筛选技术SELEX(指数富集配体系统进化)筛选出的能特异结合蛋白质或其他小分子物质的寡聚核苷酸片段。它是一系列单链核酸分子,与特异靶分子相结合,特异性如同抗体一样,对可结合的配体有严格的识别能力和高度的亲和力。

发明内容

本发明的目的在于提供一种基于DNA自组装和G四聚体的分子检测方法及检测试剂盒。

本发明所采取的技术方案是:

一种基于DNA自组装和G四聚体的检测试剂盒,包括TMB显色缓冲液、氯高铁血红素、DNA杂交缓冲液,还包括如下核酸序列:

DNA1:将待测分子核酸适体的一端适当延伸,形成DNA1,延伸的核酸序列中,靠近待测分子核酸适体的核酸序列依次记为1*、2*和3*区;

DNA2:DNA2至少与DNA1的1*区域和待测分子核酸适体的部分核酸互补配对;

DNA3:具有茎环结构,其核酸序列依次为1、2、3、4*、3*、2*、5*和6*区,2、3和2*、3*互补配对形成茎结构,环为4*区,1、2、3分别和DNA1的1*、2*和3*区互补配对;

DNA4:具有茎环结构,其核酸序列依次为3、4、3*、2*和4*区,4和4*区形成茎结构,环为3*和2*区,3、4、3*、2*区分别和DNA3的3*、4*、3、2区互补配对;

DNA5:依次为5*、6*和G四聚体封闭区,5*、6*区与DNA3的5*和6*区相同;

DNA6:依次为G四聚体、6、5、和2区,6、5、和2区分别和DNA3的6*、5*和2*互补配对。

作为上述检测试剂盒的进一步改进,DNA2至少与待测分子核酸适体的8个碱基互补配对。

作为上述检测试剂盒的进一步改进,1~6、1*~6*区中,每个区至少含有6个碱基。

作为上述检测试剂盒的进一步改进,DNA5的G四聚体封闭区至少与DNA6的G四聚体中的6个碱基互补配对。

作为上述检测试剂盒的进一步改进,对1~6、1*~6*区核酸序列中的至少一个核苷酸进行修饰,以在不改变碱基配对原则的情况下提高核酸序列之间的亲和力。

一种双酚A的检测试剂盒,包括TMB显色缓冲液、氯高铁血红素、DNA杂交缓冲液,还包括如下核酸序列:

DNA1:5'-CGACATCT(3*)AACCTAGC(2*)TCACTGAC(1*)CCGGTGGGTGGTCAGGTGGGATAGCGTTCCGCGTATGGCCCAGCGCATCACGGGTTCGCACCA-3'(SEQ ID NO:1);

DNA2:5'-TAAGCTGGAAGCGTCAGTGA-3'(SEQ ID NO:2);

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