[发明专利]一种先天性耳聋基因多通道荧光PCR检测试剂盒在审
申请号: | 201510090246.7 | 申请日: | 2015-02-27 |
公开(公告)号: | CN104694644A | 公开(公告)日: | 2015-06-10 |
发明(设计)人: | 冯振;景叶松;弭兆元;史桂芝 | 申请(专利权)人: | 济南英盛生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 杨琪;崔苗苗 |
地址: | 250100 山东省济*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 先天性 耳聋 基因 通道 荧光 pcr 检测 试剂盒 | ||
1.一种先天性耳聋基因多通道荧光PCR检测试剂盒,其特征在于,以GJB2基因的35delG、155delTCTG、176del16bp、235delC、299-300delAT、512insAACG突变,和GJB3基因的538C>T、547G>A突变为检测对象,设计特异性引物和探针,所述特异性引物包括用于扩增35delG、155delTCTG、176del16bp、235delC、299-300delAT的引物1,其序列如序列表中SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示;用于扩增512insAACG的引物2,其序列如序列表中SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示;用于扩增538C>T和547G>A的引物3,其序列如序列表中SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示;所述探针为特异性检测GJB2基因的35、155、176、235、299位点,和GJB3基因的538、547位点是否含有突变,其探针序列如序列表中SEQ ID NO:7至SEQ ID NO:14所示。
2.如权利要求1所述的一种先天性耳聋基因多通道荧光PCR检测试剂盒,其特征在于,所述探针还分别连接有荧光发光基团和荧光淬灭基团,其中,用于检测235、299、176位点的探针的荧光发光基团分别为VIC、ROX、Cy5;用于检测35、155、512、538、547位点的探针的荧光发光基团均为TAMRA;各探针的荧光淬灭基团均为BHQ-1。
3.如权利要求1所述的一种先天性耳聋基因多通道荧光PCR检测试剂盒,其特征在于,还包括用于监测扩增模板的有效性的1对β-Actin内参引物和1条内参探针,其序列分别如序列表中SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16和SEQ ID NO:17所示。
4.如权利要求3所述的一种先天性耳聋基因多通道荧光PCR检测试剂盒,其特征在于,所述内参探针为荧光标记的探针,其荧光发光基团为FAM,荧光淬灭基团为BHQ-1。
5.如权利要求1所述的一种先天性耳聋基因多通道荧光PCR检测试剂盒,其特征在于,还包括有阴性质控、阳性质控;
所述阴性质控为连入T载体的内参基因、正常GJB2基因、正常GJB3基因部分序列,其序列如序列表中SEQ ID NO:18所示;阳性质控为连入T载体的内参基因、含235、299、176、512突变位点部分序列,其序列如序列表中SEQ ID NO:19所示。
6.一种先天性耳聋基因多通道荧光PCR检测试剂盒,其特征在于,其具体组成为:DNA提取液、PCR反应液、阴性质控和阳性质控;其中,每50μl PCR反应液的组成为:10×PCR缓冲液5.0μl、MgCl22.0~5.0mM、dNTPs 0.5~1.5mM、引物0.2~2.0μM、探针0.1~1.0μM、Taq酶2.0~4.0U、UNG酶0.5~1.0U,加水至50μl。
7.如权利要求6所述的一种先天性耳聋基因多通道荧光PCR检测试剂盒,其特征在于,所述引物为引物1、引物2、引物3和内参引物,其序列分别如序列表中SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:6和SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16所示。
8.如权利要求6所述的一种先天性耳聋基因多通道荧光PCR检测试剂盒,其特征在于,所述探针为8条检测是否含有突变的探针和1条内参探针,其序列分别如序列表中SEQ ID NO:7至SEQ ID NO:14和SEQ ID NO:17所示。
9.如权利要求6所述的一种先天性耳聋基因多通道荧光PCR检测试剂盒,其特征在于,所述阴性质控为连入T载体的内参基因、正常GJB2基因、正常GJB3基因部分序列,其序列如序列表中SEQ ID NO:18所示;阳性质控为连入T载体的内参基因、含235、299、176、512突变位点部分序列,其序列如序列表中SEQ ID NO:19所示。
10.权利要求1-9任一项所述的先天性耳聋基因多通道荧光PCR检测试剂盒的检测方法,其特征在于,步骤如下:将待检测样品的DNA提取液、PCR反应液、阴性质控和阳性质控加入到PCR反应管内,混匀后置于荧光定量PCR仪上进行PCR扩增反应,PCR反应条件如下:50℃2min;95℃3min;95℃15s,60℃45s,40个循环,每个循环在60℃采集荧光;根据扩增曲线的信号情况定性判断是否存在突变。
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