[发明专利]一种用于检测LEPR基因245bpdeletion可变剪接体的引物、试剂盒及检测方法有效

专利信息
申请号: 201510077497.1 申请日: 2015-02-13
公开(公告)号: CN104673912B 公开(公告)日: 2017-03-29
发明(设计)人: 刘小军;王丹丹;徐春林;李转见;王台安;蒋瑞瑞;闫峰宾;康相涛 申请(专利权)人: 河南农业大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 郑州天阳专利事务所(普通合伙)41113 代理人: 聂孟民
地址: 450002*** 国省代码: 河南;41
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 检测 lepr 基因 245 bpdeletion 可变 剪接 引物 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种用于检测LEPR基因245bp deletion可变剪接体的引物,其特征在于,包括引物对P和引物对ACTB,

所述的引物对P为:

上游引物,P-F:5’- TCCCTACCAAGATGCTGAC -3’;

下游引物,P-R:5’- TTGCTCGCGATCGTTCACA -3’;

所述的引物对ACTB为:

上游引物,ACTB-F:5’- GAGAGAAGATGACACAGAC -3’;

下游引物,ACTB-R:5’- GTCCATCACAATACCAGTGG -3’。

2.一种用于检测LEPR基因245bp deletion可变剪接体的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的引物对P、引物对ACTB、2×SYBR?Premix Ex TaqTM和去RNA酶的超纯水。

3.一种检测LEPR基因245bp deletion可变剪接体的的方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)以待测cDNA为模板,以权利要求1所述的引物对ACTB为引物,实时荧光定量PCR扩增ACTB内参基因,以权利要求1所述的引物对P为引物,实时荧光定量PCR扩增LEPR基因245bp deletion可变剪接体,所述的荧光定量PCR扩增的反应体系包括有2×SYBR?Premix Ex TaqTM 9~11μL,去RNA酶的超纯水7~8μL,引物P-F或ACTB-F0.5~1μL,引物P-R或ACTB-R0.5~1μL,cDNA模板0.5~1.5μL构成,其反应方法是92~96℃预变性4~6min,92~96℃变性8~12s,55~65℃退火25~35 s,70~74℃延伸25~35s,35~45个循环;

(2)对步骤(1)的荧光定量PCR实时监测结果进行扩增曲线和熔解曲线分析,采用 2-△CT相对定量的方法计算,用SPSS version 20.0进行差异显著性检验。

4.根据权利要求3所述的检测LEPR基因245bp deletion可变剪接体的方法,其特征在于,所述的反应体系包括有2×SYBR?Premix Ex TaqTM 10.0μL,去RNA酶的超纯水7.4μL,引物P-F或ACTB-F0.8μL,引物P-R或ACTB-R0.8μL,cDNA模板1.0μL构成,其反应方法是94℃预变性5min,94℃变性10 s,60℃退火 30 s,72℃延伸30s,40个循环。

5.根据权利要求3所述的检测LEPR基因245bp deletion可变剪接体的方法,其特征在于,所述步骤(1)中引物对ACTB的扩增产物长度为116bp,引物对P的扩增产物长度为161bp。

6.根据权利要求3所述的检测LEPR基因245bp deletion可变剪接体的方法,其特征在于,

所述步骤(2)中采用相对定量方法计算该剪接体的相对表达量=2-△CT =2-(CTLEPR-CTACTB),为方便比较结果均乘以1000;所述的SPSS version 20.0软件差异显著性检验,采用单因素方差分析,P≤0.01表示差异极显著,所有结果均以平均值和标准差来表示。

7.权利要求1所述的引物对P和引物对ACTB在检测LEPR基因245bp deletion可变剪接体中的应用。

8.权利要求2所述的试剂盒在检测LEPR基因245bp deletion可变剪接体中的应用。

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