[发明专利]一种检测平头炭疽菌的环介导等温扩增引物组合物及其应用有效
申请号: | 201510031690.1 | 申请日: | 2015-01-21 |
公开(公告)号: | CN104593502B | 公开(公告)日: | 2017-01-25 |
发明(设计)人: | 郑小波;田擎;陆辰晨;王帅帅;张海峰;王源超 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司32218 | 代理人: | 傅婷婷,徐冬涛 |
地址: | 211225 江苏省南京市溧*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 平头 炭疽 环介导 等温 扩增 引物 组合 及其 应用 | ||
1.SEQ ID NO.1所示的Rpb1基因序列作为检测靶标在检测平头炭疽菌中的应用。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于SEQ ID NO.1所示的Rpb1基因序列作为检测靶标在LAMP检测平头炭疽菌中的应用。
3.一种用于LAMP检测平头炭疽菌的引物组合物,其特征在于由SEQ ID NO.2所示的正向外引物Rpb1-F3,SEQ ID NO.3所示的反向外引物Rpb1-B3,SEQ ID NO.4所示的正向内引物Rpb1-FIP,SEQ ID NO.5所示的反向内引物Rpb1-BIP,SEQ ID NO.6所示的环引物Rpb1-LF组成。
4.权利要求3所述的引物组合物在检测平头炭疽菌中的应用。
5.权利要求3所述的引物组合物在制备平头炭疽菌检测试剂中的应用。
6.一种用于检测平头炭疽菌的LAMP试剂盒,其特征在于包含权利要求3所述的引物组合物。
7.根据权利要求6所述的LAMP试剂盒,其特征在于包含检测溶液,每毫升所述的检测溶液通过以下方法制备得到:0.8μM正向内引物Rpb1-FIP、0.8μM反向内引物Rpb1-BIP、0.1μM正向外引物Rpb1-F3、0.1μM反向外引物Rpb1-B3、0.1μM环引物Rpb1-LF、1.4mMdNTPs、8mMMgSO4、0.8M甜菜碱、0.8M Tris-HCl(pH8.8)、0.4mM KCl、0.4mM(NH4)2SO4、4%Triton X-100、8U·μL-1Bst DNA polymerase,加入超纯水制备成1mL检测溶液。
8.根据权利要求6或7所述的LAMP试剂盒,其特征在于所述的试剂盒还含有染料SYBR Green I。
9.一种LAMP检测平头炭疽菌的方法,其特征在于包括取18μL权利要求7所述的检测溶液,3μL灭菌去离子水,加入4μL待检DNA溶液,总体积为25μL进行LAMP反应;反应程序为:62℃,70min;扩增后加入染料SYBR Green I作为反应指示剂,肉眼观察,以SYBR Green I的颜色变化和荧光强弱做为结果判定标准:在常光下,黄绿色表示检测为阳性,即有平头炭疽菌存在,橙色表示检测结果为阴性,即不含有平头炭疽菌,或所含平头炭疽菌未达检测限。
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