[发明专利]用于抗TL1A疗法的系统、装置和方法

权利要求书

1.一种为受试者选择治疗的方法，其包括：

从所述受试者获得样本；

测定所述样本中一个或多个与TL1A信号传导相关的生物标记 的表达水平；

将所述表达水平与所述一个或多个与TL1A信号传导相关的生 物标记的表达水平的参考值进行比较；和

如果相对于所述一个或多个与TL1A信号传导相关的生物标记 的参考值，所述受试者具有高表达水平，那么给所述受试者开抗TL1A 疗法的治疗方案，或者，如果相对于所述一个或多个与TL1A信号传 导相关的生物标记的参考值，所述受试者不具有高表达水平，那么不 给所述受试者开抗TL1A疗法的治疗方案。

2.如权利要求1所述的方法，其还包括在测定所述样本中所述 一个或多个与TL1A信号传导相关的生物标记的表达水平之前，用 IL12、IL18、或TL1A或者它们的组合刺激所述样本。

3.如权利要求1所述的方法，其中所述一个或多个与TL1A信 号传导相关的生物标记在本文的表1、表4、表5和/或表6中列出。

4.如权利要求1所述的方法，其中所述一个或多个与TL1A信 号传导相关的生物标记选自由以下组成的组：BIRC3、C17orf49、 CCL20、CSF2、CD274、CD74、EPSTI1、FAS、GBP1、GBP4、GBP5、 HAPLN3、IFNG、IRF1、NFKBIA、NFKB2、RELB、RGS1、SGK1、 STAT1、TAP1和TRAFD1。

5.如权利要求1所述的方法，其中所述一个或多个与TL1A信 号传导相关的生物标记选自由以下组成的组：BATF、CCL20、CD274、 CD83、CDKN1A、CHAC1、CSF2、DUSP5、FEZ1、GADD45G、 HMSD、IFNG、IL22、IL26、IL4I1、IRF8、LTA、MFSD2A、MYO1B、 NFKBIA、RPL21、SGK1、TNFRSF18、TNFRSF4、TRAF4和XIST。

6.如权利要求1所述的方法，其中所述受试者为人。

7.如权利要求1所述的方法，其中所述受试者具有TL1A相关 疾病的症状。

8.如权利要求1所述的方法，其中所述受试者疑似患有TL1A 相关疾病。

9.如权利要求1所述的方法，其中所述受试者被诊断为患有 TL1A-相关疾病。

10.如权利要求1所述的方法，其中所述样本包括T细胞、CD4⁺T细胞、CD8⁺T细胞、CD56⁺T细胞、CD45R0⁺T细胞、CD45RA⁺T 细胞、NK细胞、外周血单核细胞(PBMC)、或外周血淋巴细胞(PBL) 或者它们的组合。

11.如权利要求7所述的方法，其中所述TL1A-相关疾病为纤维 化、克罗恩病(CD)、炎性肠病(IBD)、慢性阻塞性肺病、过敏性肺 炎、哮喘、动脉硬化、狼疮、类风湿性关节炎(RA)、多发性硬化(MS)、 银屑病、1型糖尿病、肺癌、结肠癌、白血病、淋巴瘤、移植排斥、 移植物抗宿主病或中枢神经系统损伤。

12.如权利要求2所述的方法，其中测定所述样本中在表1、表 4、表5和/或表6中所列的一个或多个基因的表达水平包括测定 mRNA水平。

13.如权利要求12所述的方法，其中测定mRNA水平包括使用 RNA测序、RNA印迹、原位杂交、杂交阵列、基因表达的系列分析 (SAGE)、逆转录PCR、实时PCR、实时逆转录PCR、或定量PCR 或者它们的组合。

14.如权利要求12所述的方法，其中测定mRNA水平包括使所 述样本与多核苷酸探针接触，从而形成探针-靶标杂交复合物，所述 多核苷酸探针能够与表1、表4、表5和/或表6中所列的一个或多个 基因的mRNA特异性杂交。