[发明专利]用于对cMET核酸进行多模态分析的组合物及方法

权利要求书

1.一种用于对cMET的改变进行检测的测定法，所述测定法包括：

将核酸样本的部分与两个引物组相接触，其中，第一引物组检测cMET基因拷贝数变异的改变，第二引物组检测cMET基因表达水平的变化；

其中，所述第一引物组包含对cMET的至少一种gDNA特异性序列和至少两个参照基因各自的至少一种gDNA特异性序列进行扩增的引物对亚组，其中，一个参照基因位于7号染色体，一个参照基因不位于7号染色体，从而对cMET基因拷贝数变异进行检测；

其中，所述第二引物组包含对cMET的mRNA特异性序列和至少两个参照基因的mRNA特异性序列进行扩增的引物对亚组；

对包含所述样本的所述部分和所述两个引物组的反应混合物实施PCR扩增方案，所述扩增方案包括链分离、引物退火和引物延伸的循环；

检测各引物对的扩增子水平；

针对参照基因扩增子将cMET扩增子水平归一化；以及

将归一化的cMET扩增子水平与参照水平进行比较，其中，与所述参照水平相比gDNA特异性cMET扩增子水平更高表明所述样本中存在cMET基因扩增的改变，与所述参照水平相比mRNA特异性cMET扩增子水平改变表明所述样本中存在cMET基因表达水平的改变。

2.如权利要求1所述的测定法，其中，所述第一引物组进一步包含对EGFR的至少一种gDNA特异性序列进行扩增的引物对亚组；以及

所述测定法进一步包括将归一化的EGFR扩增子水平与参照水平进行比较，其中，与所述参照水平相比gDNA特异性EGFR扩增子水平更高表明所述样本中存在EGFR基因扩增的改变。

3.如权利要求1或2所述的测定法，其中，所述第一引物组中位于7号染色体的参照基因是KDELR-2；以及

所述测定法进一步包括将归一化的KDELR-2扩增子水平与参照水平进行比较，其中，与所述参照水平相比gDNA特异性KDELR-2扩增子水平更高表明所述样本中存在KDELR-2基因扩增的改变。

4.如权利要求1-3中任一项所述的测定法，其中，存在cMET、EGFR和KDELR-2基因扩增的改变表明存在7号染色体扩增。

5.如权利要求1-4中任一项所述的测定法，其中，所述第一引物组中不位于7号染色体的参照基因是SOD1或SPG21。

6.如权利要求5所述的测定法，其中，所述第一引物组包含对SOD1和SPG21各自的至少一种gDNA特异性序列进行扩增的引物对亚组。

7.如权利要求1-6中任一项所述的测定法，其中，所述引物组包含对各基因的至少一种扩增子进行扩增的引物对亚组。

8.如权利要求1-7中任一项所述的测定法，其中，所述引物组包含对各基因的至少两种扩增子进行扩增的引物对亚组。

9.如权利要求1-8中任一项所述的测定法，其中，所述引物组包含对各基因的至少三种扩增子进行扩增的引物对亚组。

10.如权利要求1-9中任一项所述的测定法，其中，所述引物组包含对cMET、EGFR和KDELR-2各自的至少两种gDNA特异性扩增子以及对cMET、SOD1和SPG21各自的至少两种mRNA特异性扩增子进行扩增的引物对亚组。

11.如权利要求1-10中任一项所述的测定法，其中，所述引物组包含对cMET、EGFR和KDELR-2各自的至少三种gDNA特异性扩增子以及对cMET、SOD1和SPG21各自的至少三种mRNA特异性扩增子进行扩增的引物对亚组。

12.如权利要求1-11中任一项所述的测定法，所述测定法进一步包括：

将所述样本的第二部分与第三引物组相接触，其中，所述第三引物组包含对含有序列变异的cMET序列进行扩增的引物对亚组；

对包含所述样本的所述第二部分和所述第三引物组的反应混合物实施PCR扩增方案，所述扩增方案包括链分离、引物退火和引物延伸的循环；

检测各引物对的扩增子水平，其中，扩增子的存在表明存在该引物对对其具有特异性的序列变异。

13.如权利要求12所述的测定法，其中，cMET的一种或多种序列变异为SNP。