[发明专利]利用核苷酸类似物和解旋酶恒温扩增DNA分子的方法在审
申请号: | 201480045726.5 | 申请日: | 2014-08-14 |
公开(公告)号: | CN105658811A | 公开(公告)日: | 2016-06-08 |
发明(设计)人: | 史蒂文·奔纳;杨尊义 | 申请(专利权)人: | 史蒂文·奔纳;杨尊义 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12P19/34 |
代理公司: | 上海东创专利代理事务所(普通合伙) 31245 | 代理人: | 郭蔷;曹立维 |
地址: | 美国佛*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 核苷酸 类似物 和解 恒温 扩增 dna 分子 方法 | ||
1.一种用于合成DNA分子的流程,该DNA分子互补于目标DNA分子,其中所述的目标DNA 分子杂交与互补的DNA分子成为双螺旋,本专利所述的方法包括将双螺旋DNA孵育在缓冲水 溶液中,缓冲液中有解旋酶,脱氧核糖核酸聚合酶,2'-脱氧核苷三磷酸,和含有非天然核苷 酸的引物,该引物的序列与目标DNA分子的一个序列片段基本上互补,并且在该引物中至少 一种腺嘌呤被2-氨基嘌呤或2,6-二氨基嘌呤替代,或者引物中至少一个鸟嘌呤被肌苷取 代,或至少有一个胸腺嘧啶被2-硫代胸腺嘧啶取代,或者至少一个胞嘧啶被N4-乙烷基胞嘧 啶所取代,并且其中所述被替换的核苷酸的数目总数是2至6。
2.一种用于合成多个DNA分子的流程,这些DNA分子互补于目标DNA分子,其中所述的目 标DNA分子杂交与互补的DNA分子成为双螺旋,本专利所述的方法包括将双螺旋DNA孵育在 缓冲水溶液中,缓冲液中有解旋酶,脱氧核糖核酸聚合酶,2'-脱氧核苷三磷酸,和两种含有 非天然核苷酸的引物,一种是正向引物和另一种是反向引物,所述正向引物的序列基本上 互补与目标DNA分子的一个片段,所述的反向引物的序列基本与目标DNA分子下游某段序列 相同,并且在每一种引物中至少一种腺嘌呤被2-氨基嘌呤或2,6-二氨基嘌呤替代,或者每 一种引物中至少一个鸟嘌呤被肌苷取代,或至少有一个胸腺嘧啶被2-硫代胸腺嘧啶取代, 或者至少一个胞嘧啶被N4-乙烷基胞嘧啶所取代,并且每一种引物中被替换的核苷酸的总 数目是2至6。
3.根据权利要求1所述的流程,包括在一个或多个被取代引物的5'-末端附加一个预先 选择的寡核苷酸标记,该寡核苷酸标记至少包含下图中的一个核苷碱基
其中X选自于包含N和CH的基团,W为硝基,氰基,或另外一种吸电子基团,R是连接所指 示的杂环碱基到寡核苷酸的地方。
4.根据权利要求2所述的流程,包括在一个或多个被取代引物的5'-末端附加一个预先 选择的寡核苷酸标记,该寡核苷酸标记至少包含下图中的一个核苷碱基
其中X选自于包含N和CH的基团,W为硝基,氰基,或另外一种吸电子基团,R是连接所指 示的杂环碱基到寡核苷酸的地方。
5.根据权利要求1所述的流程,被取代的核苷酸是放置在距离引物3'-末端第二到第八 核苷酸的位置。
6.根据权利要求2所述的流程,被取代的核苷酸是放置在距离引物3'-末端第二到第八 核苷酸的位置。
7.根据权利要求1所述的流程,被取代核苷酸的总数目是4,并且这些取代核苷酸被放 置在所述引物的3'-末端第二到第五核苷酸的位置。
8.根据权利要求2所述的流程,被取代核苷酸的总数目是4,并且这些取代核苷酸被放 置在所述引物的3'-末端第二到第五核苷酸的位置。
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