[发明专利]用于使用连续染色组织上的单细胞划分的多路生物标志定量的系统和方法

权利要求书

1.一种计算机实现的用于进行生物组织中组织类型、细胞单位和亚细胞单位的多信道分层图像划分分析的方法，所述方法包括：

访问经连续荧光染色的生物组织的多信道多路图像所对应的图像数据以显示该生物组织中多个形态学生物标志的表达水平；

基于所述生物标志表达水平对所述图像数据进行多信道图像划分分析以鉴定该生物组织中一个或多个细胞的定位和构造；

基于所述生物标志表达水平对所述图像数据进行多信道图像划分分析以鉴定所述一个或多个细胞内一个或多个亚细胞形态学单位的定位和构造；和

在视觉显示装置上呈现所述一个或多个细胞以及所述一个或多个细胞中一个或多个亚细胞形态学单位的分层表示，

其中所述一个或多个亚细胞形态学单位包括膜或细胞质，并且其中所述图像划分分析通过使用概率地图以产生模拟膜或细胞质的环状结构鉴定所述膜或细胞质，

其中所述一个或多个亚细胞形态学单位的定位和构造通过在所述细胞内强加拓扑约束确定。

2.根据权利要求1所述的方法，进一步包括：

自动确定在所述一个或多个细胞形态学单位中生物标志在细胞水平的表达水平；和

自动确定在所述一个或多个亚细胞形态学单位中生物标志在亚细胞形态学单位水平的表达水平。

3.根据权利要求2所述的方法，进一步包括：

基于所述生物标志在亚细胞形态学单位中的表达水平自动分组多个生物组织区域。

4.根据权利要求1所述的方法，进一步包括：

进行分析以确定生物标志在所述一个或多个亚细胞形态学单位中的表达水平与所述一个或多个亚细胞形态学单位的构造之间的关系。

5.根据权利要求1所述的方法，其中所述一个或多个亚细胞形态学单位包括一个或多个核、一个或多个细胞质和/或一个或多个膜。

6.根据权利要求1所述的方法，进一步包括：

在所述视觉显示装置上以覆盖在所述一个或多个细胞以及所述一个或多个细胞中一个或多个亚细胞形态学单位的表示上的方式自动呈现生物标志表达水平的表示。

7.根据权利要求1所述的方法，进一步包括：

确定生物标志的表达水平度量，所述度量特异于所述一个或多个细胞中一个或多个亚细胞形态学单位的至少一个。

8.根据权利要求7所述的方法，其中所述生物标志表达水平的度量为所述表达水平的均值。

9.根据权利要求1所述的方法，其中所述多个形态学生物标志包括代表单一类型亚细胞形态学单位的多个生物标志。

10.根据权利要求1所述的方法，进一步包括：

基于所述生物标志表达水平和生物标志形态学对所述图像数据进行图像划分分析以鉴定至少一个基于组织的目的区域；和

在视觉显示装置上呈现所述一个或多个细胞、所述一个或多个细胞中的一个或多个亚细胞形态学单位和所述至少一个基于组织的目的区域的分层表示。

11.根据权利要求10所述的方法，其中所述一个或多个亚细胞形态学单位包括所述一个或多个细胞的细胞膜、所述一个或多个细胞的细胞质和所述一个或多个细胞的核中的至少一种；并且

在视觉显示装置上呈现所述一个或多个细胞、所述至少一个基于组织的目的区域，以及所述一个或多个细胞的细胞膜、所述一个或多个细胞的细胞质和所述一个或多个细胞的核中的所述至少一种的分层表示。

12.根据权利要求10所述的方法，其中所述至少一个基于组织的目的区域包括基质细胞的聚集或上皮细胞的聚集。