[发明专利]类病斑表型的抑制子SLM1

说明书

技术领域

本发明领域涉及植物育种和遗传学，并且具体地，涉及用于植物改良的重组DNA构建体。

相关申请的交叉引用

本申请要求提交于2013年1月31日的美国临时申请61/758937的权益，其全部内容以引用方式并入本文。

背景技术

玉米类病斑突变体(Johal等人1995BioEssays17(8)：685-692)为研究在很大程度上仍然难懂的植物细胞死亡的遗传机制提供了极佳的模型。在不同的遗传背景下许多类病斑的表型是不同的，表明天然变体可被用于遗传分析这一现象的过程以搜寻修饰物。先前的研究(Penning等人2004Genome47：961-969)在玉米近交系Mo20W的2号染色体上鉴定了一个抑制隐性类病斑突变les23的主要数量性状座位(被命名为slm1，类病斑-1的抑制子)。

发明内容

本公开包括了用于调节Slm1活性的方法和组合物。本发明提供了用于调节Slm1在宿主植物或植物细胞中的表达以调节农学特性的方法。

附图说明和序列表

根据以下的详细描述和附图以及序列表，可以更全面地理解本公开，以下的详细描述和附图以及序列表形成本申请的一部分。

图1A-图1C示出了在玉米中图位克隆slm1和在slm1处的四个突变等位基因。图1A：F2和BC群体的slm1遗传图谱。标记的上方显示了以厘摩为单位的遗传距离，并且标记的下方显示了重组体的数量。图1B：对来自野生型和Mo20W的在slm1区间的BAC克隆进行测序和注释。图1C：在玉米slm1中的四个突变等位基因的基因结构和分子表征。

图2：在玉米中les23的基因结构和突变等位基因。

图3示出了在SLM1和LES23之间的物理相互作用。LES23的全长蛋白质与来自Va35的N末端(1-187位氨基酸)有物理相互作用，但与来自Va35的全长SLM1或来自Mo20W的预测截短产物没有物理相互作用。

图4示出了slm1的精细作图步骤。

图5示出了来自BC8F2种群包含2、1、0个Slm1-Mo20W拷贝的les23-ref纯合植物(分别为从左至右)。

图6A-6B示出了来自各种植物种类的LES23同源物的多重比对。所述比对使用ClustalW比对方法进行，多重比对的默认参数是：GAPPENALTY＝10，GAPLENGTHPENALTY＝0.2，DelayDivergentSequences＝30％，DNATransitionWeight＝0.5，ProteinWeightMatrix＝Gonnet系列，DNAWeightMatrix＝IUB。在所有植物种类中在位置19处的脯氨酸是保守的，但在les23-ref突变体中变成了亮氨酸。

图7示出了slm1和les23相互作用的工作模型。

序列描述以及所附序列表遵循如37C.F.R.§1.821-1.825所列出的关于专利申请中核苷酸和/或氨基酸序列公开的规定。

SEQIDNO：1-SEQIDNO：46是本研究所用的引物。

SEQIDNO：47是来自Va35的野生型Slm1基因座的基因组核苷酸序列。

SEQIDNO：48是来自Va35的野生型Slm1基因座的编码蛋白质的核苷酸序列。

SEQIDNO：49是来自Va35的野生型SLM1蛋白质的氨基酸序列。

SEQIDNO：50是来自Mo20W的突变体slm1基因座的基因组核苷酸序列。

SEQIDNO：51来自Mo20W的突变体slm1基因座的核苷酸序列，其对应于SEQIDNO：48，蛋白质编码区。

SEQIDNO：52是SEQIDNO：51的翻译产物，存在多个翻译终止密码子。突变体slm1基因座编码截短的蛋白质(SEQIDNO：73)。

SEQIDNO：67是野生型Les23基因座的基因组核苷酸序列。

SEQIDNO：68是野生型Les23基因座的编码蛋白质的核苷酸序列。

SEQIDNO：69是野生型LES23蛋白质的氨基酸序列。