[发明专利]EGFR抑制剂的敏感性的预测方法

说明书

技术领域

本发明涉及一种通过检查从受试者中以微侵袭(微创)方式采集的生物样品中的KRAS蛋白质的基因型来预测该受试者对EGFR抑制剂的敏感性的方法。

本申请基于2013年3月19日在日本提出的特愿2013-057033号申请主张优先权，并在此援引其内容。

背景技术

表皮生长因子受体(EGFR)是包含EGFR(ErbB-1)、Her2/neu(ErbB-2)、Her3(ErbB-3)以及Her4(ErbB-4)在内的且非常密切相关的受体ErbB家族的成员。ErbB家族是在细胞的生长、分化以及生存中发挥重要作用的成长因子受体的1型酪氨酸激酶家族。对这些受体的激活而言，典型的是通过特异性配体结合来引起，且在受体家族成员之间形成异源或同源二聚体。随后，使其发生酪氨酸激酶结构域的自身磷酸化。

EGFR的激活，除了会诱导癌细胞的持续增殖和抑制作为生存中重要过程的细胞凋亡，还会诱导受体酪氨酸激酶的激活以及介导细胞的增殖、运动性、粘附性、浸润性和对化疗的耐受性的一系列下游信号传导现象。

另外，含有EGFR和HER2的该家族成员与细胞转化直接相关。因此，作为抗癌剂，目前正在开发以EGFR作为靶点的分子靶向药物。迄今为止，已进行了抗EGFR抗体和小分子EGFR酪氨酸激酶抑制剂(TKI)这两种主要类型的EGFR抑制剂的临床试验。西妥昔单抗(Cetuximab)等抗EGFR抗体被设计成与EGFR的细胞外域结合以阻碍EGFR下游的信号的激活。西妥昔单抗(其作为抗体225也是公知的，参见专利文献1)是针对表达出高水平的野生型EGFR的A431细胞进行制作而成。与此相对比，吉非替尼(化合物ZD1839，易瑞沙)和厄洛替尼(化合物OSI-774，特罗凯)等小分子TKI会竞争用于结合在EGFR酪氨酸激酶的细胞内催化结构域的ATP。其结果是，阻碍了EGFR自身磷酸化和下游信号。

近年来，在临床上逐渐明确了作为大肠癌的分子靶向药物的西妥昔单抗、帕尼单抗的治疗有效性与突变的KRAS基因或其蛋白质之间的关系、作为肺癌的分子靶向药物的吉非替尼、厄洛替尼的治疗有效性与突变的EGFR基因或其蛋白质之间的关系、以及作为ALK抑制剂的克唑替尼的治疗有效性与伴随易位的融合基因或其蛋白质之间的关系。在这些药物的使用中，包含检查KRAS突变在内的伴随诊断(companion diagnostic)受到关注。具体而言，在CRYSTAL(FOLFIRI)试验的III期(Phase III)大肠癌患者中，KRAS野生型患者在西妥昔单抗并用时的有效率为59.3％，与此相比，KRAS变异型患者在西妥昔单抗并用时的有效率为36.2％，针对KRAS变异型患者的西妥昔单抗的有效率戏剧性地达到了较低的结果(例如，参见非专利文献1)。随后，在OPUS(FOLFOX)试验的II期(Phase II)大肠癌患者中，也证明了西妥昔单抗对KRAS变异型患者的有效率极低而对野生型患者是有效的。根据这些试验效果，确定了在大肠癌患者中的突变KRAS基因成为EGFR抑制剂的治疗效果预测因子(例如，参见非专利文献2)。另外，还报告了，KRAS野生型组的治疗效果也差的情况下，BRAF、PIK3CA中存在变异的临床试验结果。然而，目前的情况是作为超过KRAS的超级无应答者(super non-responder)证据还很少。

在通过KRAS的基因诊断来进行的EGFR抑制剂治疗方面，存在如下3个与来自受试者的样品和耐药性有关的问题。

第一个问题是，在不进行外科切除的病例中，虽然在KRAS基因诊断中使用活检标本，但其可靠性没有得到确认。另外，活检取材对于患者而言是侵袭性的，在切除原发灶后，多数情况下无法再切除复发肿瘤。因此，人们期待一种可替代直接检查肿瘤组织中的KRAS状况(KRAS的基因型)的方法的可靠性高的诊断标志物。

第二个问题是不局限于转移灶与原发灶中的变异状况一致的情况。

渡边等人报告了43例大肠癌患者中有15例为变异型患者，而原发灶与转移灶的一致率为88.4％(参见非专利文献3)。即，原发灶与转移灶的KRAS变异状况不一致的情况约占一成。另一方面，S.Gattenlohner等报告了EGFR抑制剂治疗中原发灶和转移灶的变化。对21例转移性大肠癌患者在治疗前后的状况进行了研究，其结果是有20例(95.2％)没有发生改变。发生变化的一例是异质性且为多发性病例(参见非专利文献4)。