[发明专利]支架化肽文库以及其制备和筛选方法

权利要求书

1.不同肽化合物的文库，其中

所述文库的每个化合物包含不同的可变结构域以及肽支架结构域，其中所述肽支架结构域选自：DiGeorge综合征关键区域8(DGCR8)二聚体化结构域；Get5C-末端结构域；来自E.coli的H-NS结构域；KorBc-末端二聚体化结构域；Lsr2二聚体化结构域；PKA-RIα二聚体化/停靠结构域(牛)；p62的UBA结构域；SpoVT的N-末端结构域；胶原XI三聚体化结构域；Symfoil4P三聚体(被称为β-三叶肽)；RNA聚合酶α亚基的C-末端结构域；EphA2SAM结构域；高尔基体蛋白245的GRIP结构域；SpoOB-螺旋发夹结构域；Ku的C-末端结构域；Cue2蛋白的CUE结构域；DNA解旋酶RuvA结构域；蛋白G的GA结构域；Hirustasin；凝血调节蛋白(EGF型结构域)；凝集因子VIIa；PEM-1样蛋白；成束蛋白-2；CD46细胞外结构域；核苷酸交换因子C-末端结构域；TDRD3的Tudor结构域；转录抗终止蛋白NusG；CCL2趋化因子；与ThiF复合的ThiS蛋白；胰凝乳蛋白酶抑制子；羧肽酶抑制子；CD2bp2的GYF结构域；Cdk调节亚基1；CN2毒素；CHD4–PHD指结构域；GATA型锌指；Leech衍生类胰蛋白酶抑制子；RhodninKazal抑制子；MHCII型p41片段；抗TRAP；TNF受体17(BCMA)；NZF锌指结构域；Amaranthα淀粉酶抑制子；Sac7d(Nanofitins)；APPIKunitz结构域；FynSH3结构域(Fynomers)；E3泛素蛋白连接酶UBR5；DNA修复核酸内切酶XPF；链B:rad23hom.B,xpcb结构域；链B:dsk2-uba结构域；链C:LEM结构域/伊默菌素；链A:蛋白YBL047CUBA结构域；链A/B:PKA停靠/二聚体化结构域；链C:GspC；链A:噬菌体IF1附接蛋白G3P；链A:cd2apsh3；链B:微线蛋白6,EGF-样结构域；链B:大肠杆菌素-A；链B:玉红氧还蛋白2；链E:LDLR的EGF结构域；链I:工程化蛋白酶抑制子,SGPI支架；链B:工程化hcksh3；N-末端片段:NTL9；植物甜蛋白；胰岛素生长因子结合蛋白(IGFBP)；火鸡卵类粘蛋白,第三结构域(OMTKY3)；粘霉素A1；染色盒蛋白同系物5；绒毛蛋白头部亚结构域；和蛋白Z结构域。

2.权利要求1所述的文库，其中所述肽支架结构域选自图33至34中的支架1、2、3、4、5、10、12、13、14、15、16、18、22、23、25、27、29、32、38、40、41、46、47、48、49、51、55和70。

3.权利要求2所述的文库，其中所述文库的每个化合物包含5个或更多个不同的突变。

4.权利要求3所述的文库，其中所述5个或更多个不同的突变是位于所述支架结构域的蛋白质-蛋白质相互作用区域中的非核心突变。

5.根据权利要求1所述的文库，其中所述文库包含50种或更多种不同的化合物。

6.根据权利要求3所述的文库，其中所述5个或更多个不同的非核心突变选择自图1-30和35中所述的那些。

7.根据权利要求3所述的文库，其中所述可变结构域位于所述蛋白质-蛋白质相互作用区域并且包含约500至约的表面积。

8.根据权利要求1所述的文库，其中所述文库是噬菌体展示文库，并且所述文库的每个化合物与至少部分病毒外壳蛋白融合。

9.根据权利要求15所述的文库，其中所述病毒外壳蛋白选自蛋白pIII、主要外壳蛋白pVIII、Soc、Hoc、gpD、pv1及其变体。