[发明专利]一种与马氏珠母贝壳型与重量大小相关联的SNP411871标记及引物和应用在审
| 申请号： | 201410856947.2 | 申请日： | 2014-12-31 |
| 公开（公告）号： | CN104711343A | 公开（公告）日： | 2015-06-17 |
| 发明（设计）人： | 何毛贤;李耀国 | 申请（专利权）人： | 中国科学院南海海洋研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司： | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人： | 朱聪聪;刘明星 |
| 地址： | 510301 *** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 珠母 贝壳 重量 大小 相关 snp411871 标记 引物 应用 | ||
1.一种与马氏珠母贝壳型与重量大小相关联的SNP411871标记的检测引物，其特征在于，其核苷酸序列如下：
411871FI:GGAAACGGAATTCACATTCATTATCTTTA；
411871RI:AATGTCAAGCTGGATATAATTTAGCTCTA；
411871FO:AAATTATTGAAACTATTTCACCGATTCG；
411871RO:TTGTGATTTCATTTTCGTATCAATATTCTT。
2.一种与马氏珠母贝壳型与重量大小相关联的SNP411871标记，其特征在于，其检测引物为：
411871FI:GGAAACGGAATTCACATTCATTATCTTTA；
411871RI:AATGTCAAGCTGGATATAATTTAGCTCTA；
411871FO:AAATTATTGAAACTATTTCACCGATTCG；
411871RO:TTGTGATTTCATTTTCGTATCAATATTCTT 。
3.权利要求2所述的与马氏珠母贝壳型与重量大小相关联的SNP411871标记在鉴定马氏珠母贝壳长、铰合线长、软体部重和闭壳肌重大小中的应用，其特征在于，包括以下步骤：
a、提取马氏珠母贝样品基因组DNA；
b、采用权利要求1所述的检测引物411871FI、411871RI、411871FO、411871RO对马氏珠母贝样品基因组DNA进行PCR扩增；
c、根据PCR扩增产物对马氏珠母贝样品进行鉴定，当出现具有200bp和171bp大小2条带的为AT型；当只出现200bp大小1条带的为AA型；当只出现171bp大小1条带的为TT型。AT型个体的壳长、绞合线长、软体部重和肌肉重显著大于TT型个体的样品；AA型 个体软体部重显著大于TT型个体。
4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述的PCR扩增，其PCR反应体系为：25μL；PCR反应体系如下：包含马氏珠母贝样品基因组DNA 50ng，2×PCR Mixture 12.5μL，浓度为10pmol/μL的权利要求1所述的检测引物411871FI 2μL、411871RI 2μL、411871FO0.5μL、411871RO 0.5μL，0.0625U Taq DNA酶，余量为水；反应条件为：94℃预变性5min；94℃40s，56℃40s；72℃40s，35个循环；72℃延伸5min。
5.权利要求2所述的与马氏珠母贝壳型和重量大小关联的SNP411871标记在马氏珠母贝分子标记辅助育种中的应用。
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