[发明专利]一种预示和鉴定鸡腹部脂肪量的分子标记方法及应用有效
申请号: | 201410834956.1 | 申请日: | 2014-12-29 |
公开(公告)号: | CN104513858A | 公开(公告)日: | 2015-04-15 |
发明(设计)人: | 李辉;张珂;张慧 | 申请(专利权)人: | 东北农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京爱普纳杰专利代理事务所(特殊普通合伙) 11419 | 代理人: | 张勇 |
地址: | 150030 黑龙*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 预示 鉴定 腹部 脂肪 分子 标记 方法 应用 | ||
1.一种预示和鉴定鸡腹部脂肪量的分子标记方法,其特征在于,根据鸡蛋白前体加工酶1基因SNP位点g.28897G>A和g.29161C>T上下游250bp序列设计引物,再根据所得引物进行鸡基因组DNA的PCR扩增,之后利用限制性内切酶对扩增产物进行酶切,再对酶切产物进行电泳分离,最后利用限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术分析基因多态性,获得鸡腹脂标记基因型;
所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.4所示。
2.权利要求1所述方法,其特征在于,所述鸡腹部脂肪量,是指鸡的腹脂重和腹脂率。
3.权利要求1所述方法,其特征在于,步骤如下:
1)根据鸡蛋白前体加工酶1基因SNP位点g.28897G>A和g.29161C>T上下游250bp序列设计引物,获得扩增引物;
2)利用步骤1)所得的扩增引物进行鸡基因组DNA的PCR扩增,获得扩增产物;
3)利用限制性内切酶对步骤2)所得的扩增产物进行酶切,获得酶切产物;
4)利用琼脂糖凝胶对步骤3)所得的酶切产物进行电泳分离,获得分离产物;
5)利用限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术对步骤4)所得的分离产物进行基因型分析,获得鸡腹脂标记基因型。
4.权利要求3所述方法,其特征在于,步骤1)所述扩增引物,核苷酸序列如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.4所示。
5.权利要求3所述方法,其特征在于,步骤3)所述限制性内切酶,是限制性内切酶HPY188I和HinfI。
6.权利要求3所述方法,其特征在于,步骤4)所述琼脂糖凝胶,琼脂糖凝胶的浓度为1.5%。
7.权利要求3所述方法,其特征在于,步骤5)所述基因型分析,分析的部位是鸡蛋白前体加工酶1基因的3’UTR区。
8.权利要求7所述方法,其特征在于,所述分析的部位,分析的位点是SEQ ID NO.5所示鸡蛋白前体加工酶1基因序列的第57位和第321位的碱基的替换突变。
9.权利要求3所述方法,其特征在于,步骤5)所述鸡腹脂标记基因型,当鸡蛋白前体加工酶1基因位点g.28897G>A为G碱基时,酶切产物琼脂糖凝胶电泳条带大小为282bp,将其命名为GG基因型;当鸡蛋白前体加工酶1基因位点g.28897G>A为A碱基时,酶切产物琼脂糖凝胶电泳条带大小为565bp,将其命名为AA基因型;该位点杂合的个体酶切产物琼脂糖凝胶电泳条带为两条,大小分别为282bp和565bp,将其命名为AG基因型;当鸡蛋白前体加工酶1基因位点g.29161C>T为C碱基时,酶切产物琼脂糖凝胶电泳条带大小为253bp,将其命名为CC基因型;当鸡蛋白前体加工酶1基因位点g.29161C>T为T碱基时,酶切产物琼脂糖 凝胶电泳条带大小为506bp,将其命名为TT基因型;该位点杂合的个体酶切产物琼脂糖凝胶电泳条带为两条,大小分别为203bp和506bp,将其命名为CT基因型。
10.权利要求1-9所述方法,其特征在于,用于鸡的遗传育种。
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