[发明专利]检测桃潜隐花叶类病毒的NASBA引物、试剂盒和方法有效
申请号: | 201410831330.5 | 申请日: | 2014-12-29 |
公开(公告)号: | CN104498633A | 公开(公告)日: | 2015-04-08 |
发明(设计)人: | 吴兴海;张成标;魏晓棠;张云霞;宋涛;赵丽青;王简;尼秀媚 | 申请(专利权)人: | 山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/94 |
代理公司: | 济南泉城专利商标事务所37218 | 代理人: | 褚庆森 |
地址: | 266002山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 潜隐 花叶 类病毒 nasba 引物 试剂盒 方法 | ||
1.检测桃潜隐花叶类病毒的NASBA扩增引物,其上游引物、下游引物的序列分别为 SEQ ID NO:1~2。
2.一种检测桃潜隐花叶类病毒的NASBA扩增试剂盒,包括如下组分:
(1)NASBA扩增反应液A:
每25 μL包括10×AMV buffer 2.5 μl,6.25mmol /L NTPs 3 μL,10 mmol /L dNTPs 1.5 μL,10 μmol /L引物NA-P1、NA-P2各0.5 μL,双蒸水9 Μl;
其中缓冲液为含40 mmol /L PH8.5 Tris-HCL,70 mmol /LKCL,12 mmol /L MgCL2,5 mmol /L DTT缓冲液;
(2)NASBA扩增反应液B:
0.5 U RNaseH,32 U T7RNA 聚合酶,6.4 U AMV 反转录酶,2 μL DMSO,0.1 μL1 mol /L 二硫苏糖醇,0.25 μL 10 mg /mL BSA,20 U RNA 酶抑制剂。
3.检测桃潜隐花叶类病毒的NASBA方法,包括下列步骤:
1)样品RNA的提取
A、取0.1 g样品,加液氮研磨成粉末状,将研磨物迅速移入1.5 mL离心管中,加入1 mL Trizol Reagent,颠倒混匀,2℃~8℃,12000 g,离心10min;
B、取上清,15℃~30℃,放置5min;加入0.2 mL氯仿,用手剧烈震荡,不要涡旋振荡,15s;15℃~30℃,放置2min~3min;2℃~8℃,12000 g,离心15min;
C、吸取600 μL的上层水相,勿扰动中间相和下层相,加500 μL异丙醇混合上清液,15℃~30℃,放置10min,2℃~8℃,12000 g,离心10min;
D、去除上清液,沉淀中加入1 mL 75%乙醇,洗涤;2℃~8℃,7500 g,离心5min;
E、去除上清液,沉淀自然干燥后,将其溶于30 μL ~50 μL无RNase的水中,即为待检模板RNA;
2)进行PLMVd的NASBA扩增
A、 在装有14 μL环介导等温扩增反应液A的反应管中加入3μL 待检模板RNA;
B、在DNA扩增仪或水浴锅上65℃温浴5 min,立即转入41℃温浴5 min;
C. 在反应管中迅速加入4 μL反应液B;
D. 于41℃温育2 h;
E. 将金属浴调到4 ℃中止反应,3 min后取出;
3)电泳检测
取3 g琼脂糖,于100 mL 电泳缓冲液中加热,充分溶化,加入溴化乙锭贮存液至终浓度为0.5 mg/mL,制胶,在电泳槽中加入电泳缓冲液,使液面刚刚没过凝胶;将3 mL~6 mL PCR扩增产物分别和适量加样缓冲液混合,点样;9 V/cm恒压电泳,直至溴酚蓝指示剂迁移至凝胶中部;紫外检测仪下观察电泳结果并记录。
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