[发明专利]一种快速检验杂交西瓜种子荃抗绿霸纯度的方法有效
| 申请号: | 201410788486.X | 申请日: | 2014-12-17 |
| 公开(公告)号: | CN104480208A | 公开(公告)日: | 2015-04-01 |
| 发明(设计)人: | 王慧;张从合;陈金节;严志;周桂香;黄艳玲;钱奕道;杨坤;方玉;王林 | 申请(专利权)人: | 安徽荃银高科种业股份有限公司;安徽荃银高科瓜菜种子有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 安徽合肥华信知识产权代理有限公司 34112 | 代理人: | 余成俊 |
| 地址: | 230088 *** | 国省代码: | 安徽;34 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 快速 检验 杂交 西瓜 种子 荃抗绿霸 纯度 方法 | ||
1.一种快速检验杂交西瓜种子荃抗绿霸纯度的方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)提取西瓜杂交品种荃抗绿霸样品基因组DNA;
2)以西瓜杂交品种荃抗绿霸样品基因组的DNA为模板,选用SSR引物对进行PCR扩增;
所述的SSR引物序列为:
QYXG3F :5’-CCCTATTGCCCATTTTTCTCA-3’,
QYXG3R :5’-AAATTTGTGCTCTCCGTGGG-3’;
QYXG7F :5’-CATTGCCGTTTCCATTTTCTTCAC-3’,
QYXG7R:5’-GTAACATCCAGCAGTTCGCCAT-3’;
3)将步骤2)的扩增产物经8%的双垂直板非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,220 V稳压电泳直至溴酚蓝指示剂迁移至可以使扩增DNA片段能够被清楚识别的距离时,停止电泳;银染法染色,拍照记录待测西瓜杂交品种荃抗绿霸样品DNA的特征谱带;
4) 提取西瓜杂交品种荃抗绿霸父母本样品的基因组DNA,然后重复上述步骤 2)-3)的方法,获得父母本样品DNA的特征谱带;
5)以父母本样品DNA的特征谱带作为对照,只有同时具有亲本特征谱带的单株才为真正的“荃抗绿霸”杂交种,缺少亲本任意一个特征谱带均被视为非杂交种;再采用下式计算受检样品的种子纯度:
受检样品的种子纯度(%)=(供检样品株数-非杂交种株数)/供检样品株数×100。
2.根据权利要求1所述的一种快速检验杂交西瓜种子荃抗绿霸纯度的方法,其特征在于:步骤1)是采用快速提取法提取待测样品DNA。
3.根据权利要求2所述的一种快速检验杂交西瓜种子荃抗绿霸纯度的方法,其特征在于:步骤1)具体方法为:剪取西瓜杂交品种荃抗绿霸样品种子发芽3-4天后1 cm左右的幼芽,装入2 ml离心管,加入0.4 M的NaOH溶液,用组织捣碎仪打碎样品,沸水水浴1 min左右后加入pH 8.0的Tris-HCl缓冲液,充分混匀,得西瓜杂交品种荃抗绿霸样品DNA提取液即为待测西瓜杂交品种荃抗绿霸基因组DNA,4℃下保存备用。
4.根据权利要求1所述的一种快速检验杂交西瓜种子荃抗绿霸纯度的方法,其特征在于:
步骤2)包括以下步骤:在PCR 反应板内加入西瓜杂交品种荃抗绿霸样品基因组DNA、含Mg2+的buffer、dNTPs、SSR引物、Taq酶和ddH2O;先进行94℃下的预变性5 min;接着以94℃下变性30 sec、55℃退火30 sec、72℃下延伸30 sec为一个循环,进行35个循环反应;最后在72℃下延伸5 min,反应完成后,加入Loading buffer终止反应,得西瓜杂交品种荃抗绿霸的扩增产物,4℃下保存备用。
5.根据权利要求1所述的一种快速检验杂交西瓜种子荃抗绿霸纯度的方法,其特征在于:步骤2)中,所述的西瓜杂交品种荃抗绿霸样品基因组DNA浓度为10-50 ng/μl、含Mg2+的buffer为含Mg2+的10×buffer、dNTPs浓度为2.5 mM、SSR引物浓度为2 μM、Taq酶浓度为5 U/μl;所述的10-50 ng/μl西瓜杂交品种荃抗绿霸样品基因组DNA、含Mg2+的10×buffer、2.5 mM dNTPs、2 μM SSR引物、5 U/μl Taq 酶和ddH2O 的体积比为:2∶1.5∶1∶2∶0.2∶3.3。
6.根据权利要求3所述的一种快速检验杂交西瓜种子荃抗绿霸纯度的方法,其特征在于:步骤1)中,NaOH 溶液与Tris-HCl溶液的体积比为1:1。
7.根据权利要求1所述的一种快速检验杂交西瓜种子荃抗绿霸纯度的方法,其特征在于:步骤3)中,所述浓度为8%的聚丙烯酰胺溶液由20 ml ddH2O、4 ml 10×TBE、16 ml 20% Acr-Bis、40 μl TEMED、400 μl 10% AP配制而成。
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