[发明专利]一种用于检测肺孢子虫的引物、探针和试剂盒在审
申请号: | 201410734495.0 | 申请日: | 2014-12-04 |
公开(公告)号: | CN104593485A | 公开(公告)日: | 2015-05-06 |
发明(设计)人: | 刘茹;桑筱筱 | 申请(专利权)人: | 湖北永邦医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京三高永信知识产权代理有限责任公司 11138 | 代理人: | 徐立 |
地址: | 436031 湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 孢子 引物 探针 试剂盒 | ||
技术领域
本发明涉及生物技术领域,特别涉及一种用于检测肺孢子虫的引物、探针和试剂盒。
背景技术
肺孢子虫(Pneumocystis)是一种呈世界性分布的机会致病性病原体,肺孢子虫最早发现于豚鼠体内。肺孢子虫作为致病性病原体,可以引起严重的肺部疾患称肺孢子虫肺炎(Pnuemocystis Pneumonia,PCP)。
现有技术中常采用环介导恒温扩增法(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测肺孢子虫,环介导恒温扩增是一种新的核酸扩增方法,采用环介导恒温扩增法检测肺孢子虫的过程,试剂容易被污染,因此,在操作时需要非常规范,即便规范操作有时也可能会引起污染,大大降低了检测的成功率。
发明内容
为了解决现有技术中检测肺孢子虫成功率低的问题,本发明实施例提供了一种用于检测肺孢子虫的引物、探针和试剂盒。所述技术方案如下:
一方面,本发明实施例提供了一种用于检测肺孢子虫的引物和探针,所述引物和探针包括:用于检测肺孢子虫的正向引物、用于检测肺孢子虫的反向引物和用于检测肺孢子虫的探针,其中,
所述用于检测肺孢子虫的正向引物如序列表中SEQ ID NO.1所示;
所述用于检测肺孢子虫的反向引物如序列表中SEQ ID NO.2所示;
所述用于检测肺孢子虫的探针如序列表中SEQ ID NO.3所示;
所述探针的5’端连接有荧光基团FAM、HEX、TET、JOE、VIC、ROX、Cy3或Cy5,所述探针的3’端连接有淬灭基团TAMRA、Eclipse、BHQ1、BHQ2、BHQ3或DABCYL。
另一方面,本发明实施例提供了一种用于检测肺孢子虫的试剂盒,所述试剂盒包括上述的引物和探针。
具体地,所述试剂盒还包括:核酸释放剂、PCR反应液、临界阳性质控品、阳性质控品、阴性质控品和工作标准品。
具体地,所述核酸释放剂包括无菌水、终浓度为0.03-0.3%的聚乙二醇辛基苯基醚、终浓度为0.04-0.4%的壬基酚聚氧乙烯(40)醚和pH值为8.3的终浓度为0.01-0.1M的三(羟甲基)氨基甲烷。
具体地,所述PCR反应液各组分在PCR扩增反应体系中包括:终浓度为0.01U/μL~0.05U/μL的Taq酶、终浓度为0.2~0.6mM的dNTPs、10×PCR缓冲液和终浓度为1.5~5.0mM的含Mg离子的溶液。
具体地,所述临界阳性质控品包括含浓度为1.0×104拷贝/mL的肺孢子虫基因片段的溶液。
具体地,所述引物的终浓度为0.05-0.9μM,所述探针的终浓度为0.05-0.9μM。
具体地,所述工作标准品包括:工作标准品1、工作标准品2、工作标准品3和工作标准品4,其中,
所述工作标准品1为含有1.0×107拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段;
所述工作标准品2为含有1.0×106拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段;
所述工作标准品3为含有1.0×105拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段;
所述工作标准品4为含有1.0×104拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段。
具体地,,所述阳性质控品包括含浓度为1.0×106拷贝/mL的肺孢子虫基因片段的溶液。
具体地,所述阴性质控品为浓度0.8%生理盐水。
本发明实施例提供的技术方案带来的有益效果是:本发明实施例提供的用于检测肺孢子虫的引物和探针,具有灵敏度高的特性,使得本发明实施例提供的用于检测肺孢子虫的试剂盒,具有灵敏度高的特性,采用仪器收集荧光信号,避免了肉眼判断的主观性,其检测结果可靠,提高了检测的灵敏度,即使仅存在单拷贝的目的片段该试剂盒也可以进行有效的检测;检测速度快,整个检测过程共仅需2~3小时。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例中的技术方案,下面将对实施例描述中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图仅仅是本发明的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1是本发明实施例2提供的荧光扩增曲线图;
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