[发明专利]使用编码靶向核酸内切酶附着体载体的基因组编辑方法及试剂盒在审

专利信息
申请号: 201410733267.1 申请日: 2014-12-08
公开(公告)号: CN104450785A 公开(公告)日: 2015-03-25
发明(设计)人: 王永明;麦瑞天;陈少波 申请(专利权)人: 复旦大学
主分类号: C12N15/85 分类号: C12N15/85;C12Q1/68
代理公司: 上海正旦专利代理有限公司 31200 代理人: 陆飞;盛志范
地址: 200433 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 使用 编码 靶向 核酸 内切酶 附着 载体 基因组 编辑 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种用于修饰细胞的基因组编辑方法,其特征在于具体步骤为:

首先,构建一个附着体载体编码靶向核酸内切酶和筛选基因;

然后,将所述附着体载体导入到细胞中,在药物的筛选下培养细胞若干天,使所有的细胞中都含有附着体载体并稳定表达靶向核酸内切酶。

2.根据权利要求1 所述的基因组编辑方法,其特征在于所述附着体载体是病毒附着型载体: EBV、BKV、BPV-1或 SV40,或者是非病毒附着型载体: S/MAR;这类DNA载体的共同特征是能够在真核细胞中复制扩增。

3.根据权利要求1或2 所述的基因组编辑方法,其特征在于所述靶向核酸内切酶是锌指核酸酶、大范围核酸酶、转录激活物样效应物核酸酶或者规律成簇间隔短回文重复CRISPR/Cas9。

4.根据权利要求3所述的基因组编辑方法,其特征在于所述靶向核酸内切酶在特定位置切断DNA,细胞的DNA修复系统通过非同源末端连接修复法或者同源重组修复法修复DNA断裂。

5.根据权利要求1 所述的基因组编辑方法,其特征在于所述细胞是培养的细胞、原代细胞、永生细胞、干细胞、诱导的多潜能干细胞 或单细胞胚。

6.根据权利要求1 所述的基因组编辑方法,其特征在于所述细胞是人细胞、哺乳动物细胞、脊椎动物细胞、无脊椎动物细胞或单细胞真核生物。

7.根据权利要求6 所述的基因组编辑方法,其特征在于所述哺乳动物细胞包括中国仓鼠卵巢细胞、由SV40 转化的猴肾CVI 系、人胚肾系293、幼仓鼠肾细胞、小鼠Sertoli 细胞、猴肾细胞、非洲绿猴肾细胞、人宫颈癌细胞、犬肾细胞、buffalo 大鼠肝细胞、人肺细胞、人肝细胞、小鼠乳腺瘤细胞、大鼠肝瘤细胞、HIH/3T3 细胞、人U2-OS 骨肉瘤细胞、人A549 细胞、人K562 细胞、人HEK293 细胞、人HEK293T 细胞、人HCT116 细胞、人MCF-7 细胞和TRI 细胞。

8.根据权利要求3 所述的基因组编辑方法,其特征在于所述附着体载体 EBV系统,为如下几种质粒之一种:EBNA1 Cas9eGFP、EBNA1 Cas9copGFP、EBNA1 Cas9TK、EBNA1 Cas9nTK;其中: 

(一)EBNA1 Cas9eGFP 附着体载体,含有:hSpCas9内切酶,向导RNA表达系统,包括:hU6启动子、后面的骨架RNA 和它们之间的gRNA插入位点即SapI位点,嘌呤霉素,绿色荧光蛋白eGFP、质粒在真核细胞中复制的元件EBNA1和EBV oriP,在大肠杆菌中扩增质粒用的氨苄抗性基因(Amp)和复制起始点pUC origin;

(二)EBNA1 Cas9copGFP 附着体载体,含有:hSpCas9内切酶,向导RNA表达系统,包括:hU6启动子、后面的骨架RNA 和它们之间的gRNA插入位点即SapI位点,嘌呤霉素、荧光蛋白copGFP,质粒在真核细胞中复制的元件EBNA1和EBV oriP,在大肠杆菌中扩增质粒用的氨苄抗性基因(Amp)和复制起始点pUC origin;

(三)EBNA1 Cas9TK 附着体载体,含有:hSpCas9内切酶,向导RNA表达系统:hU6启动子gRNA插入位点即SapI位点、后面的骨架RNA,嘌呤霉素和1型单纯疱疹病毒胸腺嘧啶核苷激酶HSV1-tk的融合蛋白(purotk)、质粒在真核细胞中复制的元件EBNA1和EBV oriP,在大肠杆菌中扩增质粒用的氨苄抗性基因(Amp)和复制起始点pUC origin;

(四)EBNA1 Cas9nTK 附着体载体,含有:hSpCas9内切酶的突变体hSpCas9n,向导RNA表达系统:hU6启动子gRNA插入位点即SapI位点、后面的骨架RNA,嘌呤霉素和1型单纯疱疹病毒胸腺嘧啶核苷激酶HSV1-tk的融合蛋白(purotk),质粒在真核细胞中复制的元件EBNA1和EBV oriP,在大肠杆菌中扩增质粒用的氨苄抗性基因(Amp)和复制起始点pUC origin。

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